Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSH3

WDR44, WD repeat-containing protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR44Q5JSH3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
WDR44Q5JSH3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
WDR44Q5JSH3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
WDR44Q5JSH3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
WDR44Q5JSH3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
WDR44Q5JSH3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
WDR44Q5JSH3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
WDR44Q5JSH3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
WDR44Q5JSH3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
WDR44Q5JSH3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
WDR44Q5JSH3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
WDR44Q5JSH3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
WDR44Q5JSH3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
WDR44Q5JSH3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
WDR44Q5JSH3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
WDR44Q5JSH3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
WDR44Q5JSH3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
WDR44Q5JSH3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
WDR44Q5JSH3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
WDR44Q5JSH3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
WDR44Q5JSH3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
WDR44Q5JSH3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
WDR44Q5JSH3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
WDR44Q5JSH3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
WDR44Q5JSH3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
WDR44Q5JSH3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
WDR44Q5JSH3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
WDR44Q5JSH3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
WDR44Q5JSH3 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
WDR44Q5JSH3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
WDR44Q5JSH3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
WDR44Q5JSH3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
WDR44Q5JSH3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
WDR44Q5JSH3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
WDR44Q5JSH3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
WDR44Q5JSH3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
WDR44Q5JSH3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
WDR44Q5JSH3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
WDR44Q5JSH3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
WDR44Q5JSH3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
WDR44Q5JSH3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
WDR44Q5JSH3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
WDR44Q5JSH3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
WDR44Q5JSH3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
WDR44Q5JSH3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
WDR44Q5JSH3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
WDR44Q5JSH3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
WDR44Q5JSH3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
WDR44Q5JSH3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
WDR44Q5JSH3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
WDR44Q5JSH3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
WDR44Q5JSH3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
WDR44Q5JSH3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
WDR44Q5JSH3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
WDR44Q5JSH3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
WDR44Q5JSH3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
WDR44Q5JSH3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
WDR44Q5JSH3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
WDR44Q5JSH3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
WDR44Q5JSH3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
WDR44Q5JSH3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
WDR44Q5JSH3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
WDR44Q5JSH3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
WDR44Q5JSH3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
WDR44Q5JSH3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
WDR44Q5JSH3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
WDR44Q5JSH3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
WDR44Q5JSH3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
WDR44Q5JSH3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
WDR44Q5JSH3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
WDR44Q5JSH3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
WDR44Q5JSH3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
WDR44Q5JSH3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
WDR44Q5JSH3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
WDR44Q5JSH3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
WDR44Q5JSH3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
WDR44Q5JSH3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
WDR44Q5JSH3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
WDR44Q5JSH3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
WDR44Q5JSH3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
WDR44Q5JSH3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
WDR44Q5JSH3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
WDR44Q5JSH3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
WDR44Q5JSH3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
WDR44Q5JSH3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
WDR44Q5JSH3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
WDR44Q5JSH3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
WDR44Q5JSH3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
WDR44Q5JSH3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
WDR44Q5JSH3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
WDR44Q5JSH3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
WDR44Q5JSH3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
WDR44Q5JSH3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
WDR44Q5JSH3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
WDR44Q5JSH3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
WDR44Q5JSH3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
WDR44Q5JSH3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
WDR44Q5JSH3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
WDR44Q5JSH3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
WDR44Q5JSH3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms