Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHRNA6Q15825 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHRNA6Q15825 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHRNA6Q15825 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHRNA6Q15825 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHRNA6Q15825 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHRNA6Q15825 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHRNA6Q15825 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CHRNA6Q15825 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHRNA6Q15825 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHRNA6Q15825 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHRNA6Q15825 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHRNA6Q15825 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHRNA6Q15825 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CHRNA6Q15825 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHRNA6Q15825 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CHRNA6Q15825 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHRNA6Q15825 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHRNA6Q15825 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CHRNA6Q15825 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHRNA6Q15825 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHRNA6Q15825 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CHRNA6Q15825 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHRNA6Q15825 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHRNA6Q15825 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHRNA6Q15825 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHRNA6Q15825 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHRNA6Q15825 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHRNA6Q15825 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHRNA6Q15825 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHRNA6Q15825 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHRNA6Q15825 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHRNA6Q15825 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHRNA6Q15825 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHRNA6Q15825 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHRNA6Q15825 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHRNA6Q15825 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHRNA6Q15825 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHRNA6Q15825 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHRNA6Q15825 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHRNA6Q15825 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHRNA6Q15825 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHRNA6Q15825 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHRNA6Q15825 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHRNA6Q15825 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHRNA6Q15825 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHRNA6Q15825 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHRNA6Q15825 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHRNA6Q15825 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHRNA6Q15825 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHRNA6Q15825 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHRNA6Q15825 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHRNA6Q15825 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHRNA6Q15825 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHRNA6Q15825 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHRNA6Q15825 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHRNA6Q15825 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHRNA6Q15825 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHRNA6Q15825 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHRNA6Q15825 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHRNA6Q15825 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHRNA6Q15825 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CHRNA6Q15825 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHRNA6Q15825 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHRNA6Q15825 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHRNA6Q15825 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHRNA6Q15825 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHRNA6Q15825 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHRNA6Q15825 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHRNA6Q15825 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHRNA6Q15825 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHRNA6Q15825 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHRNA6Q15825 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHRNA6Q15825 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHRNA6Q15825 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHRNA6Q15825 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHRNA6Q15825 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHRNA6Q15825 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHRNA6Q15825 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHRNA6Q15825 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CHRNA6Q15825 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHRNA6Q15825 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHRNA6Q15825 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CHRNA6Q15825 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHRNA6Q15825 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHRNA6Q15825 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHRNA6Q15825 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CHRNA6Q15825 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CHRNA6Q15825 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHRNA6Q15825 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHRNA6Q15825 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHRNA6Q15825 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHRNA6Q15825 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHRNA6Q15825 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHRNA6Q15825 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CHRNA6Q15825 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHRNA6Q15825 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHRNA6Q15825 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHRNA6Q15825 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHRNA6Q15825 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
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