Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CHRNA6Q15825 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
CHRNA6Q15825 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
CHRNA6Q15825 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CHRNA6Q15825 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
CHRNA6Q15825 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
CHRNA6Q15825 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
CHRNA6Q15825 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
CHRNA6Q15825 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
CHRNA6Q15825 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CHRNA6Q15825 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
CHRNA6Q15825 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CHRNA6Q15825 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.94■■■□□ 2.7
CHRNA6Q15825 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
CHRNA6Q15825 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
CHRNA6Q15825 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
CHRNA6Q15825 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
CHRNA6Q15825 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
CHRNA6Q15825 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC31.32■■■□□ 2.6
CHRNA6Q15825 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
CHRNA6Q15825 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
CHRNA6Q15825 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC31.1■■■□□ 2.57
CHRNA6Q15825 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC31.03■■■□□ 2.56
CHRNA6Q15825 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
CHRNA6Q15825 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CHRNA6Q15825 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CHRNA6Q15825 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CHRNA6Q15825 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
CHRNA6Q15825 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
CHRNA6Q15825 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CHRNA6Q15825 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
CHRNA6Q15825 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CHRNA6Q15825 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CHRNA6Q15825 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CHRNA6Q15825 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CHRNA6Q15825 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CHRNA6Q15825 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CHRNA6Q15825 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CHRNA6Q15825 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CHRNA6Q15825 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CHRNA6Q15825 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CHRNA6Q15825 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CHRNA6Q15825 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CHRNA6Q15825 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CHRNA6Q15825 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CHRNA6Q15825 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CHRNA6Q15825 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CHRNA6Q15825 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CHRNA6Q15825 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CHRNA6Q15825 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
CHRNA6Q15825 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CHRNA6Q15825 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CHRNA6Q15825 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
CHRNA6Q15825 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CHRNA6Q15825 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CHRNA6Q15825 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CHRNA6Q15825 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CHRNA6Q15825 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CHRNA6Q15825 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CHRNA6Q15825 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CHRNA6Q15825 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CHRNA6Q15825 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CHRNA6Q15825 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CHRNA6Q15825 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CHRNA6Q15825 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CHRNA6Q15825 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CHRNA6Q15825 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CHRNA6Q15825 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CHRNA6Q15825 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CHRNA6Q15825 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CHRNA6Q15825 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CHRNA6Q15825 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CHRNA6Q15825 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CHRNA6Q15825 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CHRNA6Q15825 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CHRNA6Q15825 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CHRNA6Q15825 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
CHRNA6Q15825 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CHRNA6Q15825 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CHRNA6Q15825 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CHRNA6Q15825 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CHRNA6Q15825 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CHRNA6Q15825 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
CHRNA6Q15825 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CHRNA6Q15825 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CHRNA6Q15825 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CHRNA6Q15825 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CHRNA6Q15825 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
CHRNA6Q15825 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CHRNA6Q15825 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CHRNA6Q15825 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CHRNA6Q15825 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CHRNA6Q15825 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CHRNA6Q15825 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CHRNA6Q15825 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
CHRNA6Q15825 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CHRNA6Q15825 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CHRNA6Q15825 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CHRNA6Q15825 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CHRNA6Q15825 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
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