Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB39AQ14964 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB39AQ14964 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB39AQ14964 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB39AQ14964 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB39AQ14964 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB39AQ14964 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB39AQ14964 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB39AQ14964 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB39AQ14964 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB39AQ14964 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB39AQ14964 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB39AQ14964 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAB39AQ14964 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAB39AQ14964 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAB39AQ14964 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAB39AQ14964 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RAB39AQ14964 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAB39AQ14964 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB39AQ14964 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB39AQ14964 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB39AQ14964 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB39AQ14964 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB39AQ14964 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB39AQ14964 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB39AQ14964 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB39AQ14964 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB39AQ14964 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB39AQ14964 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB39AQ14964 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB39AQ14964 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB39AQ14964 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAB39AQ14964 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAB39AQ14964 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAB39AQ14964 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RAB39AQ14964 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RAB39AQ14964 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
RAB39AQ14964 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RAB39AQ14964 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB39AQ14964 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB39AQ14964 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB39AQ14964 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAB39AQ14964 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAB39AQ14964 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
RAB39AQ14964 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAB39AQ14964 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAB39AQ14964 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAB39AQ14964 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAB39AQ14964 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAB39AQ14964 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAB39AQ14964 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAB39AQ14964 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAB39AQ14964 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAB39AQ14964 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAB39AQ14964 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAB39AQ14964 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAB39AQ14964 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAB39AQ14964 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAB39AQ14964 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
RAB39AQ14964 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAB39AQ14964 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAB39AQ14964 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAB39AQ14964 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAB39AQ14964 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAB39AQ14964 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
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RAB39AQ14964 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAB39AQ14964 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
RAB39AQ14964 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAB39AQ14964 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
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RAB39AQ14964 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
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RAB39AQ14964 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
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RAB39AQ14964 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAB39AQ14964 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAB39AQ14964 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB39AQ14964 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB39AQ14964 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB39AQ14964 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB39AQ14964 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB39AQ14964 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB39AQ14964 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB39AQ14964 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB39AQ14964 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB39AQ14964 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB39AQ14964 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB39AQ14964 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB39AQ14964 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB39AQ14964 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB39AQ14964 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB39AQ14964 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB39AQ14964 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB39AQ14964 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB39AQ14964 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAB39AQ14964 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
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