Protein–RNA interactions for Protein: P63162

SNRPN, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPNP63162 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNRPNP63162 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNRPNP63162 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNRPNP63162 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNRPNP63162 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNRPNP63162 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNRPNP63162 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNRPNP63162 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNRPNP63162 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SNRPNP63162 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNRPNP63162 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNRPNP63162 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNRPNP63162 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNRPNP63162 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNRPNP63162 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNRPNP63162 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNRPNP63162 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNRPNP63162 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNRPNP63162 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNRPNP63162 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNRPNP63162 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNRPNP63162 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNRPNP63162 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNRPNP63162 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNRPNP63162 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNRPNP63162 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNRPNP63162 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNRPNP63162 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNRPNP63162 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SNRPNP63162 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNRPNP63162 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNRPNP63162 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNRPNP63162 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNRPNP63162 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNRPNP63162 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNRPNP63162 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNRPNP63162 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNRPNP63162 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNRPNP63162 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNRPNP63162 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNRPNP63162 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNRPNP63162 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNRPNP63162 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNRPNP63162 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNRPNP63162 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNRPNP63162 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNRPNP63162 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNRPNP63162 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNRPNP63162 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNRPNP63162 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SNRPNP63162 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SNRPNP63162 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SNRPNP63162 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SNRPNP63162 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SNRPNP63162 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNRPNP63162 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNRPNP63162 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNRPNP63162 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNRPNP63162 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNRPNP63162 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNRPNP63162 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SNRPNP63162 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNRPNP63162 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNRPNP63162 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNRPNP63162 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SNRPNP63162 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SNRPNP63162 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNRPNP63162 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNRPNP63162 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNRPNP63162 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNRPNP63162 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNRPNP63162 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SNRPNP63162 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNRPNP63162 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNRPNP63162 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SNRPNP63162 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNRPNP63162 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNRPNP63162 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNRPNP63162 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SNRPNP63162 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNRPNP63162 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNRPNP63162 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNRPNP63162 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNRPNP63162 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNRPNP63162 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNRPNP63162 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNRPNP63162 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNRPNP63162 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNRPNP63162 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNRPNP63162 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNRPNP63162 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNRPNP63162 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNRPNP63162 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNRPNP63162 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNRPNP63162 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNRPNP63162 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNRPNP63162 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNRPNP63162 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNRPNP63162 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNRPNP63162 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms