Protein–RNA interactions for Protein: P43354

NR4A2, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A2P43354 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NR4A2P43354 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NR4A2P43354 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NR4A2P43354 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NR4A2P43354 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NR4A2P43354 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NR4A2P43354 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NR4A2P43354 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NR4A2P43354 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NR4A2P43354 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NR4A2P43354 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NR4A2P43354 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NR4A2P43354 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NR4A2P43354 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NR4A2P43354 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NR4A2P43354 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NR4A2P43354 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NR4A2P43354 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NR4A2P43354 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NR4A2P43354 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NR4A2P43354 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NR4A2P43354 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NR4A2P43354 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NR4A2P43354 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NR4A2P43354 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NR4A2P43354 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NR4A2P43354 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NR4A2P43354 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NR4A2P43354 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NR4A2P43354 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NR4A2P43354 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NR4A2P43354 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NR4A2P43354 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NR4A2P43354 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NR4A2P43354 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NR4A2P43354 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NR4A2P43354 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NR4A2P43354 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NR4A2P43354 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NR4A2P43354 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NR4A2P43354 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NR4A2P43354 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NR4A2P43354 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NR4A2P43354 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NR4A2P43354 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NR4A2P43354 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NR4A2P43354 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NR4A2P43354 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NR4A2P43354 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NR4A2P43354 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NR4A2P43354 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NR4A2P43354 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NR4A2P43354 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NR4A2P43354 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NR4A2P43354 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NR4A2P43354 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NR4A2P43354 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NR4A2P43354 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NR4A2P43354 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NR4A2P43354 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NR4A2P43354 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NR4A2P43354 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NR4A2P43354 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NR4A2P43354 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NR4A2P43354 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NR4A2P43354 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NR4A2P43354 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NR4A2P43354 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NR4A2P43354 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NR4A2P43354 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NR4A2P43354 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NR4A2P43354 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NR4A2P43354 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NR4A2P43354 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NR4A2P43354 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NR4A2P43354 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NR4A2P43354 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NR4A2P43354 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NR4A2P43354 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NR4A2P43354 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NR4A2P43354 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NR4A2P43354 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NR4A2P43354 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NR4A2P43354 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NR4A2P43354 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NR4A2P43354 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NR4A2P43354 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NR4A2P43354 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NR4A2P43354 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NR4A2P43354 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NR4A2P43354 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NR4A2P43354 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NR4A2P43354 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NR4A2P43354 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NR4A2P43354 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NR4A2P43354 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NR4A2P43354 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NR4A2P43354 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NR4A2P43354 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NR4A2P43354 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms