Protein–RNA interactions for Protein: P13521

SCG2, Secretogranin-2, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG2P13521 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SCG2P13521 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SCG2P13521 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SCG2P13521 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SCG2P13521 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SCG2P13521 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SCG2P13521 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SCG2P13521 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
SCG2P13521 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SCG2P13521 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC30■■■□□ 2.39
SCG2P13521 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SCG2P13521 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SCG2P13521 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SCG2P13521 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SCG2P13521 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SCG2P13521 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SCG2P13521 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
SCG2P13521 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SCG2P13521 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
SCG2P13521 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
SCG2P13521 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
SCG2P13521 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
SCG2P13521 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
SCG2P13521 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SCG2P13521 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SCG2P13521 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
SCG2P13521 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SCG2P13521 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SCG2P13521 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SCG2P13521 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SCG2P13521 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SCG2P13521 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SCG2P13521 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SCG2P13521 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SCG2P13521 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SCG2P13521 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SCG2P13521 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SCG2P13521 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SCG2P13521 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SCG2P13521 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SCG2P13521 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SCG2P13521 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SCG2P13521 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SCG2P13521 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SCG2P13521 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SCG2P13521 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SCG2P13521 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SCG2P13521 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SCG2P13521 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SCG2P13521 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SCG2P13521 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
SCG2P13521 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SCG2P13521 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
SCG2P13521 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SCG2P13521 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SCG2P13521 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SCG2P13521 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SCG2P13521 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SCG2P13521 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SCG2P13521 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SCG2P13521 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SCG2P13521 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SCG2P13521 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SCG2P13521 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SCG2P13521 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SCG2P13521 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SCG2P13521 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SCG2P13521 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SCG2P13521 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SCG2P13521 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SCG2P13521 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SCG2P13521 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SCG2P13521 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
SCG2P13521 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SCG2P13521 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SCG2P13521 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SCG2P13521 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SCG2P13521 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
SCG2P13521 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
SCG2P13521 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SCG2P13521 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SCG2P13521 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SCG2P13521 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SCG2P13521 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SCG2P13521 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SCG2P13521 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SCG2P13521 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SCG2P13521 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SCG2P13521 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SCG2P13521 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SCG2P13521 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
SCG2P13521 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SCG2P13521 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SCG2P13521 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SCG2P13521 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SCG2P13521 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
SCG2P13521 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SCG2P13521 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SCG2P13521 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SCG2P13521 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms