Protein–RNA interactions for Protein: P01034

CST3, Cystatin-C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CST3P01034 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CST3P01034 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CST3P01034 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CST3P01034 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CST3P01034 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CST3P01034 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CST3P01034 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CST3P01034 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CST3P01034 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CST3P01034 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CST3P01034 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
CST3P01034 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CST3P01034 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
CST3P01034 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
CST3P01034 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CST3P01034 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CST3P01034 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CST3P01034 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CST3P01034 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CST3P01034 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CST3P01034 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CST3P01034 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CST3P01034 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CST3P01034 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CST3P01034 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CST3P01034 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CST3P01034 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CST3P01034 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CST3P01034 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CST3P01034 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CST3P01034 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CST3P01034 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CST3P01034 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
CST3P01034 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CST3P01034 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CST3P01034 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CST3P01034 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CST3P01034 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CST3P01034 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CST3P01034 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CST3P01034 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CST3P01034 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CST3P01034 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CST3P01034 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CST3P01034 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CST3P01034 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CST3P01034 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CST3P01034 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CST3P01034 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CST3P01034 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CST3P01034 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CST3P01034 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CST3P01034 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CST3P01034 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CST3P01034 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
CST3P01034 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CST3P01034 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CST3P01034 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CST3P01034 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CST3P01034 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CST3P01034 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CST3P01034 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CST3P01034 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CST3P01034 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CST3P01034 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CST3P01034 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CST3P01034 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CST3P01034 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CST3P01034 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CST3P01034 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CST3P01034 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CST3P01034 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CST3P01034 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CST3P01034 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CST3P01034 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CST3P01034 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CST3P01034 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CST3P01034 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CST3P01034 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CST3P01034 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CST3P01034 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CST3P01034 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CST3P01034 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CST3P01034 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CST3P01034 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CST3P01034 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CST3P01034 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CST3P01034 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CST3P01034 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CST3P01034 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CST3P01034 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CST3P01034 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CST3P01034 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CST3P01034 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CST3P01034 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CST3P01034 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CST3P01034 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CST3P01034 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CST3P01034 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CST3P01034 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms