Protein–RNA interactions for Protein: O43854

EDIL3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDIL3O43854 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
EDIL3O43854 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
EDIL3O43854 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
EDIL3O43854 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
EDIL3O43854 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
EDIL3O43854 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
EDIL3O43854 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
EDIL3O43854 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
EDIL3O43854 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
EDIL3O43854 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
EDIL3O43854 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
EDIL3O43854 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
EDIL3O43854 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
EDIL3O43854 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
EDIL3O43854 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
EDIL3O43854 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
EDIL3O43854 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
EDIL3O43854 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
EDIL3O43854 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
EDIL3O43854 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
EDIL3O43854 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
EDIL3O43854 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
EDIL3O43854 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
EDIL3O43854 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
EDIL3O43854 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
EDIL3O43854 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.53■■■□□ 2.32
EDIL3O43854 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
EDIL3O43854 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC29.52■■■□□ 2.32
EDIL3O43854 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
EDIL3O43854 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
EDIL3O43854 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
EDIL3O43854 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
EDIL3O43854 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
EDIL3O43854 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
EDIL3O43854 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
EDIL3O43854 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
EDIL3O43854 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
EDIL3O43854 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
EDIL3O43854 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
EDIL3O43854 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
EDIL3O43854 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
EDIL3O43854 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
EDIL3O43854 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
EDIL3O43854 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC29.48■■■□□ 2.31
EDIL3O43854 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
EDIL3O43854 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
EDIL3O43854 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
EDIL3O43854 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
EDIL3O43854 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
EDIL3O43854 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
EDIL3O43854 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
EDIL3O43854 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
EDIL3O43854 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
EDIL3O43854 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
EDIL3O43854 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
EDIL3O43854 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
EDIL3O43854 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
EDIL3O43854 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
EDIL3O43854 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
EDIL3O43854 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
EDIL3O43854 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
EDIL3O43854 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
EDIL3O43854 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
EDIL3O43854 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
EDIL3O43854 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
EDIL3O43854 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
EDIL3O43854 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
EDIL3O43854 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
EDIL3O43854 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
EDIL3O43854 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
EDIL3O43854 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
EDIL3O43854 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
EDIL3O43854 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
EDIL3O43854 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
EDIL3O43854 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
EDIL3O43854 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
EDIL3O43854 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
EDIL3O43854 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
EDIL3O43854 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
EDIL3O43854 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
EDIL3O43854 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
EDIL3O43854 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
EDIL3O43854 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
EDIL3O43854 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
EDIL3O43854 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
EDIL3O43854 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
EDIL3O43854 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
EDIL3O43854 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
EDIL3O43854 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
EDIL3O43854 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
EDIL3O43854 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
EDIL3O43854 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
EDIL3O43854 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
EDIL3O43854 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
EDIL3O43854 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
EDIL3O43854 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
EDIL3O43854 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
EDIL3O43854 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
EDIL3O43854 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
EDIL3O43854 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms