Protein–RNA interactions for Protein: O15075

DCLK1, Serine/threonine-protein kinase DCLK1, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLK1O15075 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
DCLK1O15075 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
DCLK1O15075 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DCLK1O15075 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DCLK1O15075 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DCLK1O15075 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.92
DCLK1O15075 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DCLK1O15075 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
DCLK1O15075 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
DCLK1O15075 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DCLK1O15075 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
DCLK1O15075 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
DCLK1O15075 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
DCLK1O15075 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
DCLK1O15075 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
DCLK1O15075 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
DCLK1O15075 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
DCLK1O15075 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
DCLK1O15075 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
DCLK1O15075 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
DCLK1O15075 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
DCLK1O15075 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
DCLK1O15075 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
DCLK1O15075 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DCLK1O15075 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
DCLK1O15075 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
DCLK1O15075 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
DCLK1O15075 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
DCLK1O15075 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
DCLK1O15075 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DCLK1O15075 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DCLK1O15075 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
DCLK1O15075 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
DCLK1O15075 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
DCLK1O15075 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
DCLK1O15075 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DCLK1O15075 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DCLK1O15075 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
DCLK1O15075 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
DCLK1O15075 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DCLK1O15075 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
DCLK1O15075 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DCLK1O15075 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
DCLK1O15075 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
DCLK1O15075 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DCLK1O15075 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DCLK1O15075 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DCLK1O15075 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DCLK1O15075 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
DCLK1O15075 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
DCLK1O15075 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
DCLK1O15075 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
DCLK1O15075 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
DCLK1O15075 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
DCLK1O15075 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
DCLK1O15075 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
DCLK1O15075 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
DCLK1O15075 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
DCLK1O15075 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
DCLK1O15075 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
DCLK1O15075 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
DCLK1O15075 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
DCLK1O15075 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
DCLK1O15075 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
DCLK1O15075 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
DCLK1O15075 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
DCLK1O15075 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
DCLK1O15075 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
DCLK1O15075 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
DCLK1O15075 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
DCLK1O15075 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
DCLK1O15075 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
DCLK1O15075 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
DCLK1O15075 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
DCLK1O15075 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
DCLK1O15075 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
DCLK1O15075 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
DCLK1O15075 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
DCLK1O15075 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
DCLK1O15075 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
DCLK1O15075 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
DCLK1O15075 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
DCLK1O15075 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
DCLK1O15075 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
DCLK1O15075 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
DCLK1O15075 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
DCLK1O15075 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
DCLK1O15075 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
DCLK1O15075 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
DCLK1O15075 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
DCLK1O15075 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
DCLK1O15075 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
DCLK1O15075 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
DCLK1O15075 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
DCLK1O15075 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
DCLK1O15075 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
DCLK1O15075 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DCLK1O15075 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
DCLK1O15075 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
DCLK1O15075 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms