Protein–RNA interactions for Protein: H3BV60

TGFBR3L, Transforming growth factor-beta receptor type 3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR3LH3BV60 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TGFBR3LH3BV60 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TGFBR3LH3BV60 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TGFBR3LH3BV60 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TGFBR3LH3BV60 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TGFBR3LH3BV60 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TGFBR3LH3BV60 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TGFBR3LH3BV60 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TGFBR3LH3BV60 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TGFBR3LH3BV60 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TGFBR3LH3BV60 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TGFBR3LH3BV60 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TGFBR3LH3BV60 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TGFBR3LH3BV60 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TGFBR3LH3BV60 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TGFBR3LH3BV60 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TGFBR3LH3BV60 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TGFBR3LH3BV60 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TGFBR3LH3BV60 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TGFBR3LH3BV60 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TGFBR3LH3BV60 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TGFBR3LH3BV60 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TGFBR3LH3BV60 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TGFBR3LH3BV60 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TGFBR3LH3BV60 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TGFBR3LH3BV60 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TGFBR3LH3BV60 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TGFBR3LH3BV60 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TGFBR3LH3BV60 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TGFBR3LH3BV60 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TGFBR3LH3BV60 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TGFBR3LH3BV60 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TGFBR3LH3BV60 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TGFBR3LH3BV60 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TGFBR3LH3BV60 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TGFBR3LH3BV60 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TGFBR3LH3BV60 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TGFBR3LH3BV60 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TGFBR3LH3BV60 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TGFBR3LH3BV60 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TGFBR3LH3BV60 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TGFBR3LH3BV60 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TGFBR3LH3BV60 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TGFBR3LH3BV60 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TGFBR3LH3BV60 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TGFBR3LH3BV60 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TGFBR3LH3BV60 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TGFBR3LH3BV60 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TGFBR3LH3BV60 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TGFBR3LH3BV60 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TGFBR3LH3BV60 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TGFBR3LH3BV60 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TGFBR3LH3BV60 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TGFBR3LH3BV60 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TGFBR3LH3BV60 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TGFBR3LH3BV60 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TGFBR3LH3BV60 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TGFBR3LH3BV60 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TGFBR3LH3BV60 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TGFBR3LH3BV60 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TGFBR3LH3BV60 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TGFBR3LH3BV60 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TGFBR3LH3BV60 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TGFBR3LH3BV60 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TGFBR3LH3BV60 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TGFBR3LH3BV60 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TGFBR3LH3BV60 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TGFBR3LH3BV60 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TGFBR3LH3BV60 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TGFBR3LH3BV60 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TGFBR3LH3BV60 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TGFBR3LH3BV60 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TGFBR3LH3BV60 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TGFBR3LH3BV60 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TGFBR3LH3BV60 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TGFBR3LH3BV60 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TGFBR3LH3BV60 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TGFBR3LH3BV60 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TGFBR3LH3BV60 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TGFBR3LH3BV60 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TGFBR3LH3BV60 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TGFBR3LH3BV60 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TGFBR3LH3BV60 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TGFBR3LH3BV60 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TGFBR3LH3BV60 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TGFBR3LH3BV60 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TGFBR3LH3BV60 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TGFBR3LH3BV60 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TGFBR3LH3BV60 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TGFBR3LH3BV60 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TGFBR3LH3BV60 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TGFBR3LH3BV60 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TGFBR3LH3BV60 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TGFBR3LH3BV60 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TGFBR3LH3BV60 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TGFBR3LH3BV60 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TGFBR3LH3BV60 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TGFBR3LH3BV60 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TGFBR3LH3BV60 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TGFBR3LH3BV60 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms