Protein–RNA interactions for Protein: B3KS81

SRRM5, Serine/arginine repetitive matrix protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM5B3KS81 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SRRM5B3KS81 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SRRM5B3KS81 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SRRM5B3KS81 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SRRM5B3KS81 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SRRM5B3KS81 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SRRM5B3KS81 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SRRM5B3KS81 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SRRM5B3KS81 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SRRM5B3KS81 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SRRM5B3KS81 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SRRM5B3KS81 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SRRM5B3KS81 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SRRM5B3KS81 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SRRM5B3KS81 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SRRM5B3KS81 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SRRM5B3KS81 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SRRM5B3KS81 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SRRM5B3KS81 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SRRM5B3KS81 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SRRM5B3KS81 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SRRM5B3KS81 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SRRM5B3KS81 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SRRM5B3KS81 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SRRM5B3KS81 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SRRM5B3KS81 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SRRM5B3KS81 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SRRM5B3KS81 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SRRM5B3KS81 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SRRM5B3KS81 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SRRM5B3KS81 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SRRM5B3KS81 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SRRM5B3KS81 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SRRM5B3KS81 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SRRM5B3KS81 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SRRM5B3KS81 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SRRM5B3KS81 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SRRM5B3KS81 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SRRM5B3KS81 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SRRM5B3KS81 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SRRM5B3KS81 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SRRM5B3KS81 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SRRM5B3KS81 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SRRM5B3KS81 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SRRM5B3KS81 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SRRM5B3KS81 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SRRM5B3KS81 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SRRM5B3KS81 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SRRM5B3KS81 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SRRM5B3KS81 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SRRM5B3KS81 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SRRM5B3KS81 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SRRM5B3KS81 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SRRM5B3KS81 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SRRM5B3KS81 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SRRM5B3KS81 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SRRM5B3KS81 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SRRM5B3KS81 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SRRM5B3KS81 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SRRM5B3KS81 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SRRM5B3KS81 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SRRM5B3KS81 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SRRM5B3KS81 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SRRM5B3KS81 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SRRM5B3KS81 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SRRM5B3KS81 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SRRM5B3KS81 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SRRM5B3KS81 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SRRM5B3KS81 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SRRM5B3KS81 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SRRM5B3KS81 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SRRM5B3KS81 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SRRM5B3KS81 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SRRM5B3KS81 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SRRM5B3KS81 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SRRM5B3KS81 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SRRM5B3KS81 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SRRM5B3KS81 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SRRM5B3KS81 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SRRM5B3KS81 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SRRM5B3KS81 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SRRM5B3KS81 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SRRM5B3KS81 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SRRM5B3KS81 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SRRM5B3KS81 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SRRM5B3KS81 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SRRM5B3KS81 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SRRM5B3KS81 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SRRM5B3KS81 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SRRM5B3KS81 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SRRM5B3KS81 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SRRM5B3KS81 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SRRM5B3KS81 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SRRM5B3KS81 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SRRM5B3KS81 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SRRM5B3KS81 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SRRM5B3KS81 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SRRM5B3KS81 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SRRM5B3KS81 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SRRM5B3KS81 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms