Protein–RNA interactions for Protein: A8MX34

KRTAP29-1, Keratin-associated protein 29-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP29-1A8MX34 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRTAP29-1A8MX34 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRTAP29-1A8MX34 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRTAP29-1A8MX34 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRTAP29-1A8MX34 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRTAP29-1A8MX34 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRTAP29-1A8MX34 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KRTAP29-1A8MX34 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KRTAP29-1A8MX34 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KRTAP29-1A8MX34 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KRTAP29-1A8MX34 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
KRTAP29-1A8MX34 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KRTAP29-1A8MX34 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KRTAP29-1A8MX34 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRTAP29-1A8MX34 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRTAP29-1A8MX34 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRTAP29-1A8MX34 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRTAP29-1A8MX34 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRTAP29-1A8MX34 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRTAP29-1A8MX34 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KRTAP29-1A8MX34 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KRTAP29-1A8MX34 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KRTAP29-1A8MX34 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRTAP29-1A8MX34 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRTAP29-1A8MX34 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRTAP29-1A8MX34 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRTAP29-1A8MX34 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRTAP29-1A8MX34 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
KRTAP29-1A8MX34 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRTAP29-1A8MX34 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KRTAP29-1A8MX34 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KRTAP29-1A8MX34 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KRTAP29-1A8MX34 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRTAP29-1A8MX34 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRTAP29-1A8MX34 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KRTAP29-1A8MX34 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KRTAP29-1A8MX34 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KRTAP29-1A8MX34 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KRTAP29-1A8MX34 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
KRTAP29-1A8MX34 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KRTAP29-1A8MX34 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KRTAP29-1A8MX34 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRTAP29-1A8MX34 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRTAP29-1A8MX34 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRTAP29-1A8MX34 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRTAP29-1A8MX34 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRTAP29-1A8MX34 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRTAP29-1A8MX34 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KRTAP29-1A8MX34 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRTAP29-1A8MX34 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRTAP29-1A8MX34 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRTAP29-1A8MX34 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRTAP29-1A8MX34 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRTAP29-1A8MX34 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KRTAP29-1A8MX34 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRTAP29-1A8MX34 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRTAP29-1A8MX34 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRTAP29-1A8MX34 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRTAP29-1A8MX34 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRTAP29-1A8MX34 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRTAP29-1A8MX34 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRTAP29-1A8MX34 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRTAP29-1A8MX34 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRTAP29-1A8MX34 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRTAP29-1A8MX34 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRTAP29-1A8MX34 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRTAP29-1A8MX34 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRTAP29-1A8MX34 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRTAP29-1A8MX34 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRTAP29-1A8MX34 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRTAP29-1A8MX34 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRTAP29-1A8MX34 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRTAP29-1A8MX34 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRTAP29-1A8MX34 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRTAP29-1A8MX34 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRTAP29-1A8MX34 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
KRTAP29-1A8MX34 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRTAP29-1A8MX34 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRTAP29-1A8MX34 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRTAP29-1A8MX34 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRTAP29-1A8MX34 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRTAP29-1A8MX34 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRTAP29-1A8MX34 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
KRTAP29-1A8MX34 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRTAP29-1A8MX34 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRTAP29-1A8MX34 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRTAP29-1A8MX34 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRTAP29-1A8MX34 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRTAP29-1A8MX34 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRTAP29-1A8MX34 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KRTAP29-1A8MX34 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRTAP29-1A8MX34 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRTAP29-1A8MX34 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRTAP29-1A8MX34 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRTAP29-1A8MX34 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRTAP29-1A8MX34 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KRTAP29-1A8MX34 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRTAP29-1A8MX34 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRTAP29-1A8MX34 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRTAP29-1A8MX34 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms