Protein–RNA interactions for Protein: A6NM36

LRRC30, Leucine-rich repeat-containing protein 30, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC30A6NM36 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRC30A6NM36 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRC30A6NM36 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRC30A6NM36 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRC30A6NM36 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRC30A6NM36 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRC30A6NM36 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRC30A6NM36 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC30A6NM36 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRC30A6NM36 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRC30A6NM36 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRC30A6NM36 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRC30A6NM36 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
LRRC30A6NM36 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRC30A6NM36 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRC30A6NM36 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRC30A6NM36 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRC30A6NM36 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRC30A6NM36 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRC30A6NM36 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRC30A6NM36 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRC30A6NM36 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRC30A6NM36 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRC30A6NM36 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRC30A6NM36 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRC30A6NM36 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRC30A6NM36 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRC30A6NM36 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRC30A6NM36 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRC30A6NM36 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRC30A6NM36 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRC30A6NM36 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRC30A6NM36 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRC30A6NM36 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRC30A6NM36 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRC30A6NM36 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRC30A6NM36 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRC30A6NM36 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRC30A6NM36 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRC30A6NM36 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRC30A6NM36 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRC30A6NM36 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRC30A6NM36 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRC30A6NM36 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRC30A6NM36 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRC30A6NM36 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRC30A6NM36 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRC30A6NM36 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRC30A6NM36 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LRRC30A6NM36 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
LRRC30A6NM36 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRRC30A6NM36 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRRC30A6NM36 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
LRRC30A6NM36 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRRC30A6NM36 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRC30A6NM36 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRRC30A6NM36 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRRC30A6NM36 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRRC30A6NM36 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRRC30A6NM36 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRRC30A6NM36 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRRC30A6NM36 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRRC30A6NM36 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRRC30A6NM36 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRC30A6NM36 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRC30A6NM36 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRC30A6NM36 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRC30A6NM36 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC30A6NM36 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC30A6NM36 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC30A6NM36 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC30A6NM36 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRC30A6NM36 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRC30A6NM36 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRC30A6NM36 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRC30A6NM36 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRC30A6NM36 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRC30A6NM36 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRC30A6NM36 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRC30A6NM36 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRC30A6NM36 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRC30A6NM36 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRC30A6NM36 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRC30A6NM36 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRC30A6NM36 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRC30A6NM36 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRC30A6NM36 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRC30A6NM36 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRC30A6NM36 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRC30A6NM36 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRC30A6NM36 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRC30A6NM36 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRC30A6NM36 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRC30A6NM36 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRC30A6NM36 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRC30A6NM36 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRC30A6NM36 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRC30A6NM36 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRC30A6NM36 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRC30A6NM36 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms