Protein–RNA interactions for Protein: A6NM36

LRRC30, Leucine-rich repeat-containing protein 30, humanhuman

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Length 301 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC30A6NM36 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
LRRC30A6NM36 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LRRC30A6NM36 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRRC30A6NM36 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
LRRC30A6NM36 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LRRC30A6NM36 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LRRC30A6NM36 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LRRC30A6NM36 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
LRRC30A6NM36 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LRRC30A6NM36 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LRRC30A6NM36 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LRRC30A6NM36 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LRRC30A6NM36 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LRRC30A6NM36 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LRRC30A6NM36 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LRRC30A6NM36 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LRRC30A6NM36 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LRRC30A6NM36 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRRC30A6NM36 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
LRRC30A6NM36 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LRRC30A6NM36 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LRRC30A6NM36 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LRRC30A6NM36 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LRRC30A6NM36 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LRRC30A6NM36 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LRRC30A6NM36 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRRC30A6NM36 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRC30A6NM36 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRRC30A6NM36 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
LRRC30A6NM36 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRRC30A6NM36 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRRC30A6NM36 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LRRC30A6NM36 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRRC30A6NM36 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRRC30A6NM36 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRRC30A6NM36 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRRC30A6NM36 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRRC30A6NM36 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRC30A6NM36 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRC30A6NM36 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRC30A6NM36 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRC30A6NM36 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRC30A6NM36 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRC30A6NM36 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRRC30A6NM36 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRRC30A6NM36 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRRC30A6NM36 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRRC30A6NM36 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRC30A6NM36 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRC30A6NM36 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC30A6NM36 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRC30A6NM36 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC30A6NM36 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC30A6NM36 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC30A6NM36 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC30A6NM36 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC30A6NM36 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC30A6NM36 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRC30A6NM36 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC30A6NM36 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC30A6NM36 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
LRRC30A6NM36 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC30A6NM36 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRC30A6NM36 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRC30A6NM36 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRC30A6NM36 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRC30A6NM36 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRC30A6NM36 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRC30A6NM36 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC30A6NM36 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC30A6NM36 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC30A6NM36 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRC30A6NM36 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRC30A6NM36 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRC30A6NM36 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRC30A6NM36 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRC30A6NM36 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRC30A6NM36 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC30A6NM36 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC30A6NM36 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC30A6NM36 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC30A6NM36 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC30A6NM36 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRRC30A6NM36 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRC30A6NM36 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC30A6NM36 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC30A6NM36 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC30A6NM36 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC30A6NM36 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRC30A6NM36 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRC30A6NM36 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRC30A6NM36 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRC30A6NM36 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC30A6NM36 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC30A6NM36 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC30A6NM36 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC30A6NM36 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC30A6NM36 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC30A6NM36 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC30A6NM36 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
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