Protein–RNA interactions for Protein: A6NI79

CCDC69, Coiled-coil domain-containing protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC69A6NI79 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
CCDC69A6NI79 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CCDC69A6NI79 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CCDC69A6NI79 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CCDC69A6NI79 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CCDC69A6NI79 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
CCDC69A6NI79 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CCDC69A6NI79 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CCDC69A6NI79 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CCDC69A6NI79 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CCDC69A6NI79 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CCDC69A6NI79 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CCDC69A6NI79 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
CCDC69A6NI79 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CCDC69A6NI79 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CCDC69A6NI79 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
CCDC69A6NI79 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
CCDC69A6NI79 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CCDC69A6NI79 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CCDC69A6NI79 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CCDC69A6NI79 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CCDC69A6NI79 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
CCDC69A6NI79 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CCDC69A6NI79 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CCDC69A6NI79 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CCDC69A6NI79 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CCDC69A6NI79 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
CCDC69A6NI79 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CCDC69A6NI79 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
CCDC69A6NI79 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
CCDC69A6NI79 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
CCDC69A6NI79 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
CCDC69A6NI79 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CCDC69A6NI79 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CCDC69A6NI79 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CCDC69A6NI79 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CCDC69A6NI79 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CCDC69A6NI79 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
CCDC69A6NI79 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CCDC69A6NI79 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
CCDC69A6NI79 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CCDC69A6NI79 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CCDC69A6NI79 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CCDC69A6NI79 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
CCDC69A6NI79 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CCDC69A6NI79 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CCDC69A6NI79 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CCDC69A6NI79 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CCDC69A6NI79 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CCDC69A6NI79 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CCDC69A6NI79 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CCDC69A6NI79 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CCDC69A6NI79 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CCDC69A6NI79 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CCDC69A6NI79 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CCDC69A6NI79 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CCDC69A6NI79 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CCDC69A6NI79 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CCDC69A6NI79 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CCDC69A6NI79 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CCDC69A6NI79 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CCDC69A6NI79 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CCDC69A6NI79 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CCDC69A6NI79 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CCDC69A6NI79 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CCDC69A6NI79 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CCDC69A6NI79 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CCDC69A6NI79 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CCDC69A6NI79 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CCDC69A6NI79 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CCDC69A6NI79 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CCDC69A6NI79 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CCDC69A6NI79 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CCDC69A6NI79 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CCDC69A6NI79 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC30.26■■■□□ 2.44
CCDC69A6NI79 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
CCDC69A6NI79 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CCDC69A6NI79 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CCDC69A6NI79 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CCDC69A6NI79 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CCDC69A6NI79 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
CCDC69A6NI79 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
CCDC69A6NI79 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CCDC69A6NI79 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
CCDC69A6NI79 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CCDC69A6NI79 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
CCDC69A6NI79 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CCDC69A6NI79 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CCDC69A6NI79 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CCDC69A6NI79 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CCDC69A6NI79 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CCDC69A6NI79 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CCDC69A6NI79 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CCDC69A6NI79 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CCDC69A6NI79 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CCDC69A6NI79 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CCDC69A6NI79 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CCDC69A6NI79 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CCDC69A6NI79 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
CCDC69A6NI79 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms