Protein–RNA interactions for Protein: R4GMX3

COMMD3-BMI1, COMMD3-BMI1 readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD3-BMI1R4GMX3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
COMMD3-BMI1R4GMX3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
COMMD3-BMI1R4GMX3 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
COMMD3-BMI1R4GMX3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
COMMD3-BMI1R4GMX3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
COMMD3-BMI1R4GMX3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
COMMD3-BMI1R4GMX3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
COMMD3-BMI1R4GMX3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
COMMD3-BMI1R4GMX3 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
COMMD3-BMI1R4GMX3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
COMMD3-BMI1R4GMX3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
COMMD3-BMI1R4GMX3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COMMD3-BMI1R4GMX3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
COMMD3-BMI1R4GMX3 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COMMD3-BMI1R4GMX3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
COMMD3-BMI1R4GMX3 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
COMMD3-BMI1R4GMX3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
COMMD3-BMI1R4GMX3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
COMMD3-BMI1R4GMX3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
COMMD3-BMI1R4GMX3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
COMMD3-BMI1R4GMX3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
COMMD3-BMI1R4GMX3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
COMMD3-BMI1R4GMX3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
COMMD3-BMI1R4GMX3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
COMMD3-BMI1R4GMX3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
COMMD3-BMI1R4GMX3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
COMMD3-BMI1R4GMX3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COMMD3-BMI1R4GMX3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
COMMD3-BMI1R4GMX3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
COMMD3-BMI1R4GMX3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
COMMD3-BMI1R4GMX3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
COMMD3-BMI1R4GMX3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
COMMD3-BMI1R4GMX3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COMMD3-BMI1R4GMX3 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
COMMD3-BMI1R4GMX3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COMMD3-BMI1R4GMX3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COMMD3-BMI1R4GMX3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COMMD3-BMI1R4GMX3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COMMD3-BMI1R4GMX3 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COMMD3-BMI1R4GMX3 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
COMMD3-BMI1R4GMX3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
COMMD3-BMI1R4GMX3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
COMMD3-BMI1R4GMX3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
COMMD3-BMI1R4GMX3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
COMMD3-BMI1R4GMX3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
COMMD3-BMI1R4GMX3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
COMMD3-BMI1R4GMX3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
COMMD3-BMI1R4GMX3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
COMMD3-BMI1R4GMX3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
COMMD3-BMI1R4GMX3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COMMD3-BMI1R4GMX3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COMMD3-BMI1R4GMX3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COMMD3-BMI1R4GMX3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COMMD3-BMI1R4GMX3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
COMMD3-BMI1R4GMX3 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
COMMD3-BMI1R4GMX3 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
COMMD3-BMI1R4GMX3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
COMMD3-BMI1R4GMX3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COMMD3-BMI1R4GMX3 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COMMD3-BMI1R4GMX3 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
COMMD3-BMI1R4GMX3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COMMD3-BMI1R4GMX3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COMMD3-BMI1R4GMX3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
COMMD3-BMI1R4GMX3 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
COMMD3-BMI1R4GMX3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
COMMD3-BMI1R4GMX3 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
COMMD3-BMI1R4GMX3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
COMMD3-BMI1R4GMX3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COMMD3-BMI1R4GMX3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COMMD3-BMI1R4GMX3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
COMMD3-BMI1R4GMX3 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
COMMD3-BMI1R4GMX3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
COMMD3-BMI1R4GMX3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
COMMD3-BMI1R4GMX3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COMMD3-BMI1R4GMX3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COMMD3-BMI1R4GMX3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COMMD3-BMI1R4GMX3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COMMD3-BMI1R4GMX3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
COMMD3-BMI1R4GMX3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COMMD3-BMI1R4GMX3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COMMD3-BMI1R4GMX3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COMMD3-BMI1R4GMX3 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
COMMD3-BMI1R4GMX3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
COMMD3-BMI1R4GMX3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
COMMD3-BMI1R4GMX3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COMMD3-BMI1R4GMX3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
COMMD3-BMI1R4GMX3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
COMMD3-BMI1R4GMX3 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
COMMD3-BMI1R4GMX3 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
COMMD3-BMI1R4GMX3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COMMD3-BMI1R4GMX3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COMMD3-BMI1R4GMX3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COMMD3-BMI1R4GMX3 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
COMMD3-BMI1R4GMX3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
COMMD3-BMI1R4GMX3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COMMD3-BMI1R4GMX3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COMMD3-BMI1R4GMX3 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COMMD3-BMI1R4GMX3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COMMD3-BMI1R4GMX3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COMMD3-BMI1R4GMX3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms