Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP18Q9UMW8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP18Q9UMW8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP18Q9UMW8 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP18Q9UMW8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP18Q9UMW8 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP18Q9UMW8 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP18Q9UMW8 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP18Q9UMW8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP18Q9UMW8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP18Q9UMW8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP18Q9UMW8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
USP18Q9UMW8 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP18Q9UMW8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP18Q9UMW8 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP18Q9UMW8 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP18Q9UMW8 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP18Q9UMW8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP18Q9UMW8 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP18Q9UMW8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP18Q9UMW8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP18Q9UMW8 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP18Q9UMW8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP18Q9UMW8 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP18Q9UMW8 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP18Q9UMW8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP18Q9UMW8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP18Q9UMW8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP18Q9UMW8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP18Q9UMW8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP18Q9UMW8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
USP18Q9UMW8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
USP18Q9UMW8 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
USP18Q9UMW8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
USP18Q9UMW8 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP18Q9UMW8 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP18Q9UMW8 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP18Q9UMW8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP18Q9UMW8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP18Q9UMW8 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP18Q9UMW8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP18Q9UMW8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP18Q9UMW8 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP18Q9UMW8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP18Q9UMW8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP18Q9UMW8 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP18Q9UMW8 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP18Q9UMW8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP18Q9UMW8 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP18Q9UMW8 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP18Q9UMW8 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP18Q9UMW8 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP18Q9UMW8 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
USP18Q9UMW8 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP18Q9UMW8 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP18Q9UMW8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP18Q9UMW8 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
USP18Q9UMW8 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
USP18Q9UMW8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
USP18Q9UMW8 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
USP18Q9UMW8 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
USP18Q9UMW8 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
USP18Q9UMW8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
USP18Q9UMW8 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
USP18Q9UMW8 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
USP18Q9UMW8 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
USP18Q9UMW8 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
USP18Q9UMW8 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
USP18Q9UMW8 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
USP18Q9UMW8 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
USP18Q9UMW8 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.54■■■□□ 2
USP18Q9UMW8 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
USP18Q9UMW8 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
USP18Q9UMW8 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
USP18Q9UMW8 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
USP18Q9UMW8 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
USP18Q9UMW8 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
USP18Q9UMW8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP18Q9UMW8 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
USP18Q9UMW8 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP18Q9UMW8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP18Q9UMW8 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP18Q9UMW8 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP18Q9UMW8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP18Q9UMW8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP18Q9UMW8 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP18Q9UMW8 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
USP18Q9UMW8 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP18Q9UMW8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP18Q9UMW8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
USP18Q9UMW8 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
USP18Q9UMW8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP18Q9UMW8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP18Q9UMW8 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP18Q9UMW8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP18Q9UMW8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
USP18Q9UMW8 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP18Q9UMW8 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP18Q9UMW8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP18Q9UMW8 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms