Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKN8

GTF3C4, General transcription factor 3C polypeptide 4, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C4Q9UKN8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GTF3C4Q9UKN8 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GTF3C4Q9UKN8 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GTF3C4Q9UKN8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GTF3C4Q9UKN8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
GTF3C4Q9UKN8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GTF3C4Q9UKN8 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GTF3C4Q9UKN8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GTF3C4Q9UKN8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GTF3C4Q9UKN8 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GTF3C4Q9UKN8 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GTF3C4Q9UKN8 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GTF3C4Q9UKN8 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GTF3C4Q9UKN8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GTF3C4Q9UKN8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GTF3C4Q9UKN8 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GTF3C4Q9UKN8 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GTF3C4Q9UKN8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GTF3C4Q9UKN8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GTF3C4Q9UKN8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GTF3C4Q9UKN8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GTF3C4Q9UKN8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GTF3C4Q9UKN8 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GTF3C4Q9UKN8 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
GTF3C4Q9UKN8 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GTF3C4Q9UKN8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GTF3C4Q9UKN8 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GTF3C4Q9UKN8 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GTF3C4Q9UKN8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GTF3C4Q9UKN8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GTF3C4Q9UKN8 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GTF3C4Q9UKN8 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GTF3C4Q9UKN8 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GTF3C4Q9UKN8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GTF3C4Q9UKN8 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GTF3C4Q9UKN8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GTF3C4Q9UKN8 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GTF3C4Q9UKN8 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GTF3C4Q9UKN8 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GTF3C4Q9UKN8 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GTF3C4Q9UKN8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GTF3C4Q9UKN8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GTF3C4Q9UKN8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GTF3C4Q9UKN8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GTF3C4Q9UKN8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
GTF3C4Q9UKN8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GTF3C4Q9UKN8 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GTF3C4Q9UKN8 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GTF3C4Q9UKN8 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
GTF3C4Q9UKN8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
GTF3C4Q9UKN8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
GTF3C4Q9UKN8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GTF3C4Q9UKN8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GTF3C4Q9UKN8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GTF3C4Q9UKN8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GTF3C4Q9UKN8 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GTF3C4Q9UKN8 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GTF3C4Q9UKN8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GTF3C4Q9UKN8 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
GTF3C4Q9UKN8 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
GTF3C4Q9UKN8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
GTF3C4Q9UKN8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GTF3C4Q9UKN8 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GTF3C4Q9UKN8 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GTF3C4Q9UKN8 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GTF3C4Q9UKN8 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GTF3C4Q9UKN8 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GTF3C4Q9UKN8 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GTF3C4Q9UKN8 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GTF3C4Q9UKN8 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
GTF3C4Q9UKN8 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
GTF3C4Q9UKN8 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
GTF3C4Q9UKN8 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
GTF3C4Q9UKN8 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
GTF3C4Q9UKN8 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GTF3C4Q9UKN8 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GTF3C4Q9UKN8 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GTF3C4Q9UKN8 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GTF3C4Q9UKN8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GTF3C4Q9UKN8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GTF3C4Q9UKN8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GTF3C4Q9UKN8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GTF3C4Q9UKN8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GTF3C4Q9UKN8 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GTF3C4Q9UKN8 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GTF3C4Q9UKN8 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GTF3C4Q9UKN8 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GTF3C4Q9UKN8 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GTF3C4Q9UKN8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GTF3C4Q9UKN8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GTF3C4Q9UKN8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GTF3C4Q9UKN8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GTF3C4Q9UKN8 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GTF3C4Q9UKN8 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
GTF3C4Q9UKN8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GTF3C4Q9UKN8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GTF3C4Q9UKN8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GTF3C4Q9UKN8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GTF3C4Q9UKN8 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GTF3C4Q9UKN8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87 ms