Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK12

ZNF222, Zinc finger protein 222, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF222Q9UK12 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF222Q9UK12 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF222Q9UK12 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF222Q9UK12 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF222Q9UK12 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF222Q9UK12 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF222Q9UK12 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF222Q9UK12 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF222Q9UK12 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF222Q9UK12 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF222Q9UK12 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF222Q9UK12 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF222Q9UK12 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF222Q9UK12 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF222Q9UK12 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF222Q9UK12 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF222Q9UK12 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF222Q9UK12 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF222Q9UK12 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF222Q9UK12 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF222Q9UK12 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF222Q9UK12 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF222Q9UK12 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF222Q9UK12 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF222Q9UK12 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF222Q9UK12 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF222Q9UK12 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF222Q9UK12 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF222Q9UK12 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF222Q9UK12 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF222Q9UK12 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF222Q9UK12 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF222Q9UK12 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF222Q9UK12 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF222Q9UK12 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF222Q9UK12 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF222Q9UK12 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF222Q9UK12 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF222Q9UK12 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF222Q9UK12 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF222Q9UK12 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF222Q9UK12 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF222Q9UK12 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF222Q9UK12 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF222Q9UK12 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF222Q9UK12 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF222Q9UK12 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF222Q9UK12 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF222Q9UK12 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF222Q9UK12 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF222Q9UK12 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF222Q9UK12 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF222Q9UK12 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF222Q9UK12 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ZNF222Q9UK12 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF222Q9UK12 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF222Q9UK12 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF222Q9UK12 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF222Q9UK12 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF222Q9UK12 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF222Q9UK12 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF222Q9UK12 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF222Q9UK12 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF222Q9UK12 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF222Q9UK12 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF222Q9UK12 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF222Q9UK12 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF222Q9UK12 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF222Q9UK12 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF222Q9UK12 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF222Q9UK12 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF222Q9UK12 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF222Q9UK12 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF222Q9UK12 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF222Q9UK12 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF222Q9UK12 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF222Q9UK12 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF222Q9UK12 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF222Q9UK12 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF222Q9UK12 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF222Q9UK12 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF222Q9UK12 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF222Q9UK12 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF222Q9UK12 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF222Q9UK12 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZNF222Q9UK12 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZNF222Q9UK12 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF222Q9UK12 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF222Q9UK12 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF222Q9UK12 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF222Q9UK12 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF222Q9UK12 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF222Q9UK12 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF222Q9UK12 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF222Q9UK12 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF222Q9UK12 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF222Q9UK12 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF222Q9UK12 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF222Q9UK12 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF222Q9UK12 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms