Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHI7

SLC23A1, Solute carrier family 23 member 1, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC23A1Q9UHI7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC23A1Q9UHI7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC23A1Q9UHI7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC23A1Q9UHI7 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC23A1Q9UHI7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SLC23A1Q9UHI7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC23A1Q9UHI7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC23A1Q9UHI7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC23A1Q9UHI7 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC23A1Q9UHI7 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC23A1Q9UHI7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC23A1Q9UHI7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC23A1Q9UHI7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC23A1Q9UHI7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC23A1Q9UHI7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC23A1Q9UHI7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC23A1Q9UHI7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC23A1Q9UHI7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC23A1Q9UHI7 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC23A1Q9UHI7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC23A1Q9UHI7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC23A1Q9UHI7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC23A1Q9UHI7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC23A1Q9UHI7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC23A1Q9UHI7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC23A1Q9UHI7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC23A1Q9UHI7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC23A1Q9UHI7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC23A1Q9UHI7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC23A1Q9UHI7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC23A1Q9UHI7 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC23A1Q9UHI7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC23A1Q9UHI7 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC23A1Q9UHI7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC23A1Q9UHI7 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC23A1Q9UHI7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC23A1Q9UHI7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC23A1Q9UHI7 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC23A1Q9UHI7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC23A1Q9UHI7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC23A1Q9UHI7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC23A1Q9UHI7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC23A1Q9UHI7 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC23A1Q9UHI7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC23A1Q9UHI7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC23A1Q9UHI7 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC23A1Q9UHI7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC23A1Q9UHI7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC23A1Q9UHI7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC23A1Q9UHI7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC23A1Q9UHI7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC23A1Q9UHI7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC23A1Q9UHI7 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC23A1Q9UHI7 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC23A1Q9UHI7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC23A1Q9UHI7 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC23A1Q9UHI7 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC23A1Q9UHI7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC23A1Q9UHI7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC23A1Q9UHI7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC23A1Q9UHI7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC23A1Q9UHI7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC23A1Q9UHI7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC23A1Q9UHI7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC23A1Q9UHI7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC23A1Q9UHI7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC23A1Q9UHI7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC23A1Q9UHI7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC23A1Q9UHI7 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC23A1Q9UHI7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC23A1Q9UHI7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC23A1Q9UHI7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC23A1Q9UHI7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC23A1Q9UHI7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC23A1Q9UHI7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC23A1Q9UHI7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC23A1Q9UHI7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC23A1Q9UHI7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC23A1Q9UHI7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC23A1Q9UHI7 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC23A1Q9UHI7 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC23A1Q9UHI7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC23A1Q9UHI7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC23A1Q9UHI7 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC23A1Q9UHI7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC23A1Q9UHI7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC23A1Q9UHI7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC23A1Q9UHI7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC23A1Q9UHI7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC23A1Q9UHI7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC23A1Q9UHI7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC23A1Q9UHI7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC23A1Q9UHI7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC23A1Q9UHI7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC23A1Q9UHI7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC23A1Q9UHI7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC23A1Q9UHI7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC23A1Q9UHI7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC23A1Q9UHI7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC23A1Q9UHI7 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms