Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD1

CHORDC1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHORDC1Q9UHD1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CHORDC1Q9UHD1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CHORDC1Q9UHD1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CHORDC1Q9UHD1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CHORDC1Q9UHD1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CHORDC1Q9UHD1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CHORDC1Q9UHD1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CHORDC1Q9UHD1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CHORDC1Q9UHD1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CHORDC1Q9UHD1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CHORDC1Q9UHD1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
CHORDC1Q9UHD1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CHORDC1Q9UHD1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CHORDC1Q9UHD1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CHORDC1Q9UHD1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CHORDC1Q9UHD1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CHORDC1Q9UHD1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CHORDC1Q9UHD1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CHORDC1Q9UHD1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CHORDC1Q9UHD1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CHORDC1Q9UHD1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CHORDC1Q9UHD1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CHORDC1Q9UHD1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CHORDC1Q9UHD1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CHORDC1Q9UHD1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CHORDC1Q9UHD1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CHORDC1Q9UHD1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CHORDC1Q9UHD1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CHORDC1Q9UHD1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CHORDC1Q9UHD1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CHORDC1Q9UHD1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CHORDC1Q9UHD1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CHORDC1Q9UHD1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CHORDC1Q9UHD1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CHORDC1Q9UHD1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CHORDC1Q9UHD1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CHORDC1Q9UHD1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CHORDC1Q9UHD1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CHORDC1Q9UHD1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CHORDC1Q9UHD1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CHORDC1Q9UHD1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CHORDC1Q9UHD1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CHORDC1Q9UHD1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
CHORDC1Q9UHD1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CHORDC1Q9UHD1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CHORDC1Q9UHD1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CHORDC1Q9UHD1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CHORDC1Q9UHD1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CHORDC1Q9UHD1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CHORDC1Q9UHD1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CHORDC1Q9UHD1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CHORDC1Q9UHD1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CHORDC1Q9UHD1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
CHORDC1Q9UHD1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CHORDC1Q9UHD1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CHORDC1Q9UHD1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
CHORDC1Q9UHD1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CHORDC1Q9UHD1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CHORDC1Q9UHD1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CHORDC1Q9UHD1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CHORDC1Q9UHD1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CHORDC1Q9UHD1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHORDC1Q9UHD1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHORDC1Q9UHD1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CHORDC1Q9UHD1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CHORDC1Q9UHD1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CHORDC1Q9UHD1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CHORDC1Q9UHD1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CHORDC1Q9UHD1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHORDC1Q9UHD1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHORDC1Q9UHD1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHORDC1Q9UHD1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHORDC1Q9UHD1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHORDC1Q9UHD1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHORDC1Q9UHD1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHORDC1Q9UHD1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHORDC1Q9UHD1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHORDC1Q9UHD1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHORDC1Q9UHD1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHORDC1Q9UHD1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHORDC1Q9UHD1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHORDC1Q9UHD1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHORDC1Q9UHD1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHORDC1Q9UHD1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CHORDC1Q9UHD1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CHORDC1Q9UHD1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CHORDC1Q9UHD1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CHORDC1Q9UHD1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CHORDC1Q9UHD1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CHORDC1Q9UHD1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CHORDC1Q9UHD1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CHORDC1Q9UHD1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CHORDC1Q9UHD1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CHORDC1Q9UHD1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHORDC1Q9UHD1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHORDC1Q9UHD1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHORDC1Q9UHD1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHORDC1Q9UHD1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHORDC1Q9UHD1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHORDC1Q9UHD1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.7 ms