Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN6

TNFRSF10D, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10D, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF10DQ9UBN6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNFRSF10DQ9UBN6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNFRSF10DQ9UBN6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNFRSF10DQ9UBN6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNFRSF10DQ9UBN6 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNFRSF10DQ9UBN6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNFRSF10DQ9UBN6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNFRSF10DQ9UBN6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNFRSF10DQ9UBN6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNFRSF10DQ9UBN6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNFRSF10DQ9UBN6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNFRSF10DQ9UBN6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNFRSF10DQ9UBN6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNFRSF10DQ9UBN6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNFRSF10DQ9UBN6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNFRSF10DQ9UBN6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNFRSF10DQ9UBN6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNFRSF10DQ9UBN6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNFRSF10DQ9UBN6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNFRSF10DQ9UBN6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TNFRSF10DQ9UBN6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNFRSF10DQ9UBN6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNFRSF10DQ9UBN6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNFRSF10DQ9UBN6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNFRSF10DQ9UBN6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNFRSF10DQ9UBN6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNFRSF10DQ9UBN6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNFRSF10DQ9UBN6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNFRSF10DQ9UBN6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNFRSF10DQ9UBN6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNFRSF10DQ9UBN6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNFRSF10DQ9UBN6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNFRSF10DQ9UBN6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNFRSF10DQ9UBN6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNFRSF10DQ9UBN6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNFRSF10DQ9UBN6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNFRSF10DQ9UBN6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNFRSF10DQ9UBN6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNFRSF10DQ9UBN6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNFRSF10DQ9UBN6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNFRSF10DQ9UBN6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNFRSF10DQ9UBN6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNFRSF10DQ9UBN6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNFRSF10DQ9UBN6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNFRSF10DQ9UBN6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNFRSF10DQ9UBN6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNFRSF10DQ9UBN6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNFRSF10DQ9UBN6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TNFRSF10DQ9UBN6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TNFRSF10DQ9UBN6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TNFRSF10DQ9UBN6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNFRSF10DQ9UBN6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNFRSF10DQ9UBN6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNFRSF10DQ9UBN6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNFRSF10DQ9UBN6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNFRSF10DQ9UBN6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNFRSF10DQ9UBN6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNFRSF10DQ9UBN6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNFRSF10DQ9UBN6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNFRSF10DQ9UBN6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNFRSF10DQ9UBN6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNFRSF10DQ9UBN6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNFRSF10DQ9UBN6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNFRSF10DQ9UBN6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNFRSF10DQ9UBN6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNFRSF10DQ9UBN6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNFRSF10DQ9UBN6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNFRSF10DQ9UBN6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNFRSF10DQ9UBN6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TNFRSF10DQ9UBN6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNFRSF10DQ9UBN6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNFRSF10DQ9UBN6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNFRSF10DQ9UBN6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNFRSF10DQ9UBN6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNFRSF10DQ9UBN6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TNFRSF10DQ9UBN6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNFRSF10DQ9UBN6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNFRSF10DQ9UBN6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNFRSF10DQ9UBN6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNFRSF10DQ9UBN6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNFRSF10DQ9UBN6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNFRSF10DQ9UBN6 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNFRSF10DQ9UBN6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNFRSF10DQ9UBN6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNFRSF10DQ9UBN6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TNFRSF10DQ9UBN6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNFRSF10DQ9UBN6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNFRSF10DQ9UBN6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNFRSF10DQ9UBN6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TNFRSF10DQ9UBN6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNFRSF10DQ9UBN6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNFRSF10DQ9UBN6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNFRSF10DQ9UBN6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNFRSF10DQ9UBN6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNFRSF10DQ9UBN6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNFRSF10DQ9UBN6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TNFRSF10DQ9UBN6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TNFRSF10DQ9UBN6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TNFRSF10DQ9UBN6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TNFRSF10DQ9UBN6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms