Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCC0

MCCC2, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCC2Q9HCC0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MCCC2Q9HCC0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MCCC2Q9HCC0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MCCC2Q9HCC0 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MCCC2Q9HCC0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MCCC2Q9HCC0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCCC2Q9HCC0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCCC2Q9HCC0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCCC2Q9HCC0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MCCC2Q9HCC0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MCCC2Q9HCC0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MCCC2Q9HCC0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MCCC2Q9HCC0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MCCC2Q9HCC0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
MCCC2Q9HCC0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MCCC2Q9HCC0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MCCC2Q9HCC0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MCCC2Q9HCC0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MCCC2Q9HCC0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MCCC2Q9HCC0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
MCCC2Q9HCC0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MCCC2Q9HCC0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MCCC2Q9HCC0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
MCCC2Q9HCC0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MCCC2Q9HCC0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MCCC2Q9HCC0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
MCCC2Q9HCC0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MCCC2Q9HCC0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MCCC2Q9HCC0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MCCC2Q9HCC0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MCCC2Q9HCC0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
MCCC2Q9HCC0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCCC2Q9HCC0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCCC2Q9HCC0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCCC2Q9HCC0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCCC2Q9HCC0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCCC2Q9HCC0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MCCC2Q9HCC0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MCCC2Q9HCC0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MCCC2Q9HCC0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MCCC2Q9HCC0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCCC2Q9HCC0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCCC2Q9HCC0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCCC2Q9HCC0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCCC2Q9HCC0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MCCC2Q9HCC0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MCCC2Q9HCC0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MCCC2Q9HCC0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MCCC2Q9HCC0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
MCCC2Q9HCC0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MCCC2Q9HCC0 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCCC2Q9HCC0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCCC2Q9HCC0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCCC2Q9HCC0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MCCC2Q9HCC0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MCCC2Q9HCC0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MCCC2Q9HCC0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MCCC2Q9HCC0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MCCC2Q9HCC0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MCCC2Q9HCC0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MCCC2Q9HCC0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MCCC2Q9HCC0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCCC2Q9HCC0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCCC2Q9HCC0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCCC2Q9HCC0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MCCC2Q9HCC0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MCCC2Q9HCC0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MCCC2Q9HCC0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MCCC2Q9HCC0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MCCC2Q9HCC0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
MCCC2Q9HCC0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MCCC2Q9HCC0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MCCC2Q9HCC0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MCCC2Q9HCC0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MCCC2Q9HCC0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MCCC2Q9HCC0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MCCC2Q9HCC0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MCCC2Q9HCC0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MCCC2Q9HCC0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MCCC2Q9HCC0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MCCC2Q9HCC0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MCCC2Q9HCC0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MCCC2Q9HCC0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MCCC2Q9HCC0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MCCC2Q9HCC0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MCCC2Q9HCC0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MCCC2Q9HCC0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MCCC2Q9HCC0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MCCC2Q9HCC0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MCCC2Q9HCC0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MCCC2Q9HCC0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MCCC2Q9HCC0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MCCC2Q9HCC0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MCCC2Q9HCC0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MCCC2Q9HCC0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MCCC2Q9HCC0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MCCC2Q9HCC0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MCCC2Q9HCC0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MCCC2Q9HCC0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MCCC2Q9HCC0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms