Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN6

SLC6A16, Orphan sodium- and chloride-dependent neurotransmitter transporter NTT5, humanhuman

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Length 736 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A16Q9GZN6 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC6A16Q9GZN6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC6A16Q9GZN6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC6A16Q9GZN6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC6A16Q9GZN6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC6A16Q9GZN6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC6A16Q9GZN6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC6A16Q9GZN6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC6A16Q9GZN6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC6A16Q9GZN6 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC6A16Q9GZN6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC6A16Q9GZN6 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC6A16Q9GZN6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC6A16Q9GZN6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC6A16Q9GZN6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC6A16Q9GZN6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC6A16Q9GZN6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC6A16Q9GZN6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC6A16Q9GZN6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC6A16Q9GZN6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC6A16Q9GZN6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC6A16Q9GZN6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC6A16Q9GZN6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC6A16Q9GZN6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC6A16Q9GZN6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC6A16Q9GZN6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLC6A16Q9GZN6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLC6A16Q9GZN6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC6A16Q9GZN6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC6A16Q9GZN6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC6A16Q9GZN6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC6A16Q9GZN6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC6A16Q9GZN6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC6A16Q9GZN6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC6A16Q9GZN6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC6A16Q9GZN6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC6A16Q9GZN6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC6A16Q9GZN6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC6A16Q9GZN6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC6A16Q9GZN6 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC6A16Q9GZN6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC6A16Q9GZN6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC6A16Q9GZN6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC6A16Q9GZN6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC6A16Q9GZN6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC6A16Q9GZN6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC6A16Q9GZN6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SLC6A16Q9GZN6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC6A16Q9GZN6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC6A16Q9GZN6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC6A16Q9GZN6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC6A16Q9GZN6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC6A16Q9GZN6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC6A16Q9GZN6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC6A16Q9GZN6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC6A16Q9GZN6 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC6A16Q9GZN6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC6A16Q9GZN6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC6A16Q9GZN6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC6A16Q9GZN6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC6A16Q9GZN6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC6A16Q9GZN6 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC6A16Q9GZN6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC6A16Q9GZN6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC6A16Q9GZN6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC6A16Q9GZN6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC6A16Q9GZN6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC6A16Q9GZN6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC6A16Q9GZN6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC6A16Q9GZN6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC6A16Q9GZN6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC6A16Q9GZN6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC6A16Q9GZN6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC6A16Q9GZN6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC6A16Q9GZN6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC6A16Q9GZN6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC6A16Q9GZN6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC6A16Q9GZN6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC6A16Q9GZN6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC6A16Q9GZN6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC6A16Q9GZN6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SLC6A16Q9GZN6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC6A16Q9GZN6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC6A16Q9GZN6 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC6A16Q9GZN6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC6A16Q9GZN6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC6A16Q9GZN6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC6A16Q9GZN6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC6A16Q9GZN6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC6A16Q9GZN6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC6A16Q9GZN6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC6A16Q9GZN6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC6A16Q9GZN6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC6A16Q9GZN6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC6A16Q9GZN6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC6A16Q9GZN6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC6A16Q9GZN6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC6A16Q9GZN6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC6A16Q9GZN6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC6A16Q9GZN6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
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