Protein–RNA interactions for Protein: Q96KC9

CABS1, Calcium-binding and spermatid-specific protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABS1Q96KC9 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CABS1Q96KC9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CABS1Q96KC9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CABS1Q96KC9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CABS1Q96KC9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CABS1Q96KC9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CABS1Q96KC9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CABS1Q96KC9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CABS1Q96KC9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CABS1Q96KC9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CABS1Q96KC9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CABS1Q96KC9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CABS1Q96KC9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CABS1Q96KC9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CABS1Q96KC9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CABS1Q96KC9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CABS1Q96KC9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CABS1Q96KC9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CABS1Q96KC9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CABS1Q96KC9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CABS1Q96KC9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CABS1Q96KC9 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CABS1Q96KC9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CABS1Q96KC9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CABS1Q96KC9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CABS1Q96KC9 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CABS1Q96KC9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CABS1Q96KC9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CABS1Q96KC9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CABS1Q96KC9 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CABS1Q96KC9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CABS1Q96KC9 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CABS1Q96KC9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CABS1Q96KC9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CABS1Q96KC9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CABS1Q96KC9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CABS1Q96KC9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CABS1Q96KC9 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CABS1Q96KC9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CABS1Q96KC9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CABS1Q96KC9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CABS1Q96KC9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CABS1Q96KC9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CABS1Q96KC9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CABS1Q96KC9 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CABS1Q96KC9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CABS1Q96KC9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CABS1Q96KC9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CABS1Q96KC9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CABS1Q96KC9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CABS1Q96KC9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CABS1Q96KC9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CABS1Q96KC9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CABS1Q96KC9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CABS1Q96KC9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CABS1Q96KC9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CABS1Q96KC9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CABS1Q96KC9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CABS1Q96KC9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CABS1Q96KC9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CABS1Q96KC9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CABS1Q96KC9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CABS1Q96KC9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CABS1Q96KC9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CABS1Q96KC9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CABS1Q96KC9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CABS1Q96KC9 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CABS1Q96KC9 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CABS1Q96KC9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CABS1Q96KC9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CABS1Q96KC9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CABS1Q96KC9 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CABS1Q96KC9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
CABS1Q96KC9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CABS1Q96KC9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CABS1Q96KC9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CABS1Q96KC9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CABS1Q96KC9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CABS1Q96KC9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CABS1Q96KC9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CABS1Q96KC9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CABS1Q96KC9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CABS1Q96KC9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CABS1Q96KC9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CABS1Q96KC9 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CABS1Q96KC9 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CABS1Q96KC9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CABS1Q96KC9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CABS1Q96KC9 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CABS1Q96KC9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CABS1Q96KC9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CABS1Q96KC9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CABS1Q96KC9 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CABS1Q96KC9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CABS1Q96KC9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CABS1Q96KC9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CABS1Q96KC9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CABS1Q96KC9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CABS1Q96KC9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CABS1Q96KC9 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms