Protein–RNA interactions for Protein: Q96K19

RNF170, E3 ubiquitin-protein ligase RNF170, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF170Q96K19 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RNF170Q96K19 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RNF170Q96K19 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RNF170Q96K19 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RNF170Q96K19 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RNF170Q96K19 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RNF170Q96K19 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RNF170Q96K19 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RNF170Q96K19 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RNF170Q96K19 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RNF170Q96K19 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RNF170Q96K19 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RNF170Q96K19 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF170Q96K19 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF170Q96K19 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF170Q96K19 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RNF170Q96K19 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RNF170Q96K19 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RNF170Q96K19 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RNF170Q96K19 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF170Q96K19 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF170Q96K19 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF170Q96K19 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF170Q96K19 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF170Q96K19 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF170Q96K19 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF170Q96K19 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF170Q96K19 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF170Q96K19 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF170Q96K19 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF170Q96K19 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF170Q96K19 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF170Q96K19 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF170Q96K19 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF170Q96K19 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF170Q96K19 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF170Q96K19 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF170Q96K19 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF170Q96K19 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF170Q96K19 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF170Q96K19 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF170Q96K19 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF170Q96K19 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF170Q96K19 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF170Q96K19 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF170Q96K19 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF170Q96K19 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF170Q96K19 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF170Q96K19 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF170Q96K19 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF170Q96K19 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF170Q96K19 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF170Q96K19 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF170Q96K19 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF170Q96K19 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF170Q96K19 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF170Q96K19 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF170Q96K19 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF170Q96K19 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF170Q96K19 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF170Q96K19 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF170Q96K19 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF170Q96K19 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF170Q96K19 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF170Q96K19 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF170Q96K19 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RNF170Q96K19 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RNF170Q96K19 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF170Q96K19 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF170Q96K19 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF170Q96K19 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF170Q96K19 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF170Q96K19 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF170Q96K19 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF170Q96K19 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF170Q96K19 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF170Q96K19 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF170Q96K19 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF170Q96K19 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF170Q96K19 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF170Q96K19 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF170Q96K19 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF170Q96K19 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF170Q96K19 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF170Q96K19 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF170Q96K19 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF170Q96K19 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RNF170Q96K19 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF170Q96K19 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF170Q96K19 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF170Q96K19 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF170Q96K19 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF170Q96K19 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF170Q96K19 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF170Q96K19 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF170Q96K19 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF170Q96K19 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF170Q96K19 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF170Q96K19 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF170Q96K19 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms