Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDB6

DTX3L, E3 ubiquitin-protein ligase DTX3L, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3LQ8TDB6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
DTX3LQ8TDB6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
DTX3LQ8TDB6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
DTX3LQ8TDB6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
DTX3LQ8TDB6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
DTX3LQ8TDB6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
DTX3LQ8TDB6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
DTX3LQ8TDB6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
DTX3LQ8TDB6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
DTX3LQ8TDB6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DTX3LQ8TDB6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DTX3LQ8TDB6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DTX3LQ8TDB6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
DTX3LQ8TDB6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
DTX3LQ8TDB6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
DTX3LQ8TDB6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
DTX3LQ8TDB6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
DTX3LQ8TDB6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
DTX3LQ8TDB6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DTX3LQ8TDB6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
DTX3LQ8TDB6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DTX3LQ8TDB6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DTX3LQ8TDB6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
DTX3LQ8TDB6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
DTX3LQ8TDB6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
DTX3LQ8TDB6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DTX3LQ8TDB6 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
DTX3LQ8TDB6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DTX3LQ8TDB6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
DTX3LQ8TDB6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
DTX3LQ8TDB6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
DTX3LQ8TDB6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
DTX3LQ8TDB6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
DTX3LQ8TDB6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
DTX3LQ8TDB6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
DTX3LQ8TDB6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
DTX3LQ8TDB6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
DTX3LQ8TDB6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
DTX3LQ8TDB6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
DTX3LQ8TDB6 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
DTX3LQ8TDB6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
DTX3LQ8TDB6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
DTX3LQ8TDB6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
DTX3LQ8TDB6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
DTX3LQ8TDB6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DTX3LQ8TDB6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DTX3LQ8TDB6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DTX3LQ8TDB6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DTX3LQ8TDB6 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
DTX3LQ8TDB6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
DTX3LQ8TDB6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
DTX3LQ8TDB6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
DTX3LQ8TDB6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
DTX3LQ8TDB6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
DTX3LQ8TDB6 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
DTX3LQ8TDB6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
DTX3LQ8TDB6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
DTX3LQ8TDB6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
DTX3LQ8TDB6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
DTX3LQ8TDB6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
DTX3LQ8TDB6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DTX3LQ8TDB6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DTX3LQ8TDB6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
DTX3LQ8TDB6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
DTX3LQ8TDB6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DTX3LQ8TDB6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
DTX3LQ8TDB6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
DTX3LQ8TDB6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
DTX3LQ8TDB6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
DTX3LQ8TDB6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
DTX3LQ8TDB6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
DTX3LQ8TDB6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
DTX3LQ8TDB6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
DTX3LQ8TDB6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
DTX3LQ8TDB6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
DTX3LQ8TDB6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
DTX3LQ8TDB6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
DTX3LQ8TDB6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
DTX3LQ8TDB6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
DTX3LQ8TDB6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
DTX3LQ8TDB6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
DTX3LQ8TDB6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
DTX3LQ8TDB6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DTX3LQ8TDB6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
DTX3LQ8TDB6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DTX3LQ8TDB6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DTX3LQ8TDB6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DTX3LQ8TDB6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DTX3LQ8TDB6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DTX3LQ8TDB6 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
DTX3LQ8TDB6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
DTX3LQ8TDB6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DTX3LQ8TDB6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DTX3LQ8TDB6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DTX3LQ8TDB6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DTX3LQ8TDB6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
DTX3LQ8TDB6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DTX3LQ8TDB6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DTX3LQ8TDB6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
DTX3LQ8TDB6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms