Protein–RNA interactions for Protein: Q8N567

ZCCHC9, Zinc finger CCHC domain-containing protein 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC9Q8N567 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
ZCCHC9Q8N567 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZCCHC9Q8N567 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZCCHC9Q8N567 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZCCHC9Q8N567 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
ZCCHC9Q8N567 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZCCHC9Q8N567 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZCCHC9Q8N567 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ZCCHC9Q8N567 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ZCCHC9Q8N567 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZCCHC9Q8N567 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZCCHC9Q8N567 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZCCHC9Q8N567 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZCCHC9Q8N567 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZCCHC9Q8N567 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZCCHC9Q8N567 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZCCHC9Q8N567 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZCCHC9Q8N567 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZCCHC9Q8N567 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZCCHC9Q8N567 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ZCCHC9Q8N567 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ZCCHC9Q8N567 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ZCCHC9Q8N567 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ZCCHC9Q8N567 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ZCCHC9Q8N567 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ZCCHC9Q8N567 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ZCCHC9Q8N567 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ZCCHC9Q8N567 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ZCCHC9Q8N567 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ZCCHC9Q8N567 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ZCCHC9Q8N567 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ZCCHC9Q8N567 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
ZCCHC9Q8N567 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ZCCHC9Q8N567 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ZCCHC9Q8N567 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ZCCHC9Q8N567 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ZCCHC9Q8N567 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ZCCHC9Q8N567 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ZCCHC9Q8N567 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZCCHC9Q8N567 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZCCHC9Q8N567 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZCCHC9Q8N567 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZCCHC9Q8N567 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZCCHC9Q8N567 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZCCHC9Q8N567 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZCCHC9Q8N567 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZCCHC9Q8N567 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ZCCHC9Q8N567 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ZCCHC9Q8N567 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ZCCHC9Q8N567 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ZCCHC9Q8N567 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ZCCHC9Q8N567 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ZCCHC9Q8N567 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
ZCCHC9Q8N567 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZCCHC9Q8N567 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZCCHC9Q8N567 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ZCCHC9Q8N567 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ZCCHC9Q8N567 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ZCCHC9Q8N567 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ZCCHC9Q8N567 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ZCCHC9Q8N567 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZCCHC9Q8N567 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZCCHC9Q8N567 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZCCHC9Q8N567 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZCCHC9Q8N567 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZCCHC9Q8N567 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZCCHC9Q8N567 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZCCHC9Q8N567 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ZCCHC9Q8N567 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ZCCHC9Q8N567 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ZCCHC9Q8N567 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ZCCHC9Q8N567 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
ZCCHC9Q8N567 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ZCCHC9Q8N567 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ZCCHC9Q8N567 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ZCCHC9Q8N567 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ZCCHC9Q8N567 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ZCCHC9Q8N567 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZCCHC9Q8N567 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ZCCHC9Q8N567 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ZCCHC9Q8N567 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ZCCHC9Q8N567 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ZCCHC9Q8N567 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ZCCHC9Q8N567 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ZCCHC9Q8N567 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ZCCHC9Q8N567 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZCCHC9Q8N567 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZCCHC9Q8N567 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZCCHC9Q8N567 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZCCHC9Q8N567 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
ZCCHC9Q8N567 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZCCHC9Q8N567 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZCCHC9Q8N567 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZCCHC9Q8N567 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZCCHC9Q8N567 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZCCHC9Q8N567 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZCCHC9Q8N567 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZCCHC9Q8N567 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ZCCHC9Q8N567 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ZCCHC9Q8N567 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms