Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXQ6

PARP9, Poly [ADP-ribose] polymerase 9, humanhuman

Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP9Q8IXQ6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PARP9Q8IXQ6 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PARP9Q8IXQ6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PARP9Q8IXQ6 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PARP9Q8IXQ6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PARP9Q8IXQ6 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PARP9Q8IXQ6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PARP9Q8IXQ6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PARP9Q8IXQ6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PARP9Q8IXQ6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PARP9Q8IXQ6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PARP9Q8IXQ6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PARP9Q8IXQ6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PARP9Q8IXQ6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PARP9Q8IXQ6 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PARP9Q8IXQ6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PARP9Q8IXQ6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PARP9Q8IXQ6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
PARP9Q8IXQ6 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PARP9Q8IXQ6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PARP9Q8IXQ6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PARP9Q8IXQ6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PARP9Q8IXQ6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PARP9Q8IXQ6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PARP9Q8IXQ6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PARP9Q8IXQ6 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
PARP9Q8IXQ6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PARP9Q8IXQ6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PARP9Q8IXQ6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PARP9Q8IXQ6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PARP9Q8IXQ6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PARP9Q8IXQ6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PARP9Q8IXQ6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PARP9Q8IXQ6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PARP9Q8IXQ6 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PARP9Q8IXQ6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PARP9Q8IXQ6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PARP9Q8IXQ6 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PARP9Q8IXQ6 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PARP9Q8IXQ6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PARP9Q8IXQ6 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PARP9Q8IXQ6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PARP9Q8IXQ6 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PARP9Q8IXQ6 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PARP9Q8IXQ6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PARP9Q8IXQ6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PARP9Q8IXQ6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PARP9Q8IXQ6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PARP9Q8IXQ6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PARP9Q8IXQ6 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PARP9Q8IXQ6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PARP9Q8IXQ6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PARP9Q8IXQ6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PARP9Q8IXQ6 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PARP9Q8IXQ6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PARP9Q8IXQ6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PARP9Q8IXQ6 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PARP9Q8IXQ6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PARP9Q8IXQ6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PARP9Q8IXQ6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PARP9Q8IXQ6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PARP9Q8IXQ6 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PARP9Q8IXQ6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PARP9Q8IXQ6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PARP9Q8IXQ6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PARP9Q8IXQ6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PARP9Q8IXQ6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PARP9Q8IXQ6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PARP9Q8IXQ6 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PARP9Q8IXQ6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PARP9Q8IXQ6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PARP9Q8IXQ6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PARP9Q8IXQ6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PARP9Q8IXQ6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PARP9Q8IXQ6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PARP9Q8IXQ6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PARP9Q8IXQ6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PARP9Q8IXQ6 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PARP9Q8IXQ6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PARP9Q8IXQ6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PARP9Q8IXQ6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PARP9Q8IXQ6 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PARP9Q8IXQ6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PARP9Q8IXQ6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PARP9Q8IXQ6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PARP9Q8IXQ6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PARP9Q8IXQ6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PARP9Q8IXQ6 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PARP9Q8IXQ6 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PARP9Q8IXQ6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PARP9Q8IXQ6 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PARP9Q8IXQ6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PARP9Q8IXQ6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PARP9Q8IXQ6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PARP9Q8IXQ6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PARP9Q8IXQ6 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PARP9Q8IXQ6 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PARP9Q8IXQ6 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PARP9Q8IXQ6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PARP9Q8IXQ6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms