Protein–RNA interactions for Protein: Q86YC2

PALB2, Partner and localizer of BRCA2, humanhuman

Predictions only

Length 1,186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALB2Q86YC2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PALB2Q86YC2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PALB2Q86YC2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PALB2Q86YC2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PALB2Q86YC2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PALB2Q86YC2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PALB2Q86YC2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PALB2Q86YC2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PALB2Q86YC2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PALB2Q86YC2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PALB2Q86YC2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PALB2Q86YC2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
PALB2Q86YC2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
PALB2Q86YC2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PALB2Q86YC2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PALB2Q86YC2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PALB2Q86YC2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PALB2Q86YC2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
PALB2Q86YC2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PALB2Q86YC2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PALB2Q86YC2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PALB2Q86YC2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PALB2Q86YC2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PALB2Q86YC2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PALB2Q86YC2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PALB2Q86YC2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PALB2Q86YC2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PALB2Q86YC2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PALB2Q86YC2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PALB2Q86YC2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PALB2Q86YC2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PALB2Q86YC2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PALB2Q86YC2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PALB2Q86YC2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PALB2Q86YC2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PALB2Q86YC2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PALB2Q86YC2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PALB2Q86YC2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PALB2Q86YC2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PALB2Q86YC2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PALB2Q86YC2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PALB2Q86YC2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PALB2Q86YC2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PALB2Q86YC2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PALB2Q86YC2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PALB2Q86YC2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
PALB2Q86YC2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
PALB2Q86YC2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PALB2Q86YC2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PALB2Q86YC2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PALB2Q86YC2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PALB2Q86YC2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PALB2Q86YC2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PALB2Q86YC2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PALB2Q86YC2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PALB2Q86YC2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
PALB2Q86YC2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PALB2Q86YC2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PALB2Q86YC2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PALB2Q86YC2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PALB2Q86YC2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PALB2Q86YC2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PALB2Q86YC2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
PALB2Q86YC2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PALB2Q86YC2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PALB2Q86YC2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PALB2Q86YC2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
PALB2Q86YC2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PALB2Q86YC2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
PALB2Q86YC2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PALB2Q86YC2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PALB2Q86YC2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PALB2Q86YC2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PALB2Q86YC2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PALB2Q86YC2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PALB2Q86YC2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PALB2Q86YC2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PALB2Q86YC2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PALB2Q86YC2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PALB2Q86YC2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PALB2Q86YC2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PALB2Q86YC2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PALB2Q86YC2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PALB2Q86YC2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PALB2Q86YC2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
PALB2Q86YC2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PALB2Q86YC2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PALB2Q86YC2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PALB2Q86YC2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PALB2Q86YC2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PALB2Q86YC2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PALB2Q86YC2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PALB2Q86YC2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PALB2Q86YC2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PALB2Q86YC2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PALB2Q86YC2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PALB2Q86YC2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PALB2Q86YC2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PALB2Q86YC2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PALB2Q86YC2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms