Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQN7

SLCO4C1, Solute carrier organic anion transporter family member 4C1, humanhuman

Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO4C1Q6ZQN7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLCO4C1Q6ZQN7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLCO4C1Q6ZQN7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLCO4C1Q6ZQN7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLCO4C1Q6ZQN7 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLCO4C1Q6ZQN7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SLCO4C1Q6ZQN7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLCO4C1Q6ZQN7 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLCO4C1Q6ZQN7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLCO4C1Q6ZQN7 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLCO4C1Q6ZQN7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLCO4C1Q6ZQN7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLCO4C1Q6ZQN7 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLCO4C1Q6ZQN7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLCO4C1Q6ZQN7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLCO4C1Q6ZQN7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLCO4C1Q6ZQN7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLCO4C1Q6ZQN7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLCO4C1Q6ZQN7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLCO4C1Q6ZQN7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SLCO4C1Q6ZQN7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLCO4C1Q6ZQN7 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLCO4C1Q6ZQN7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLCO4C1Q6ZQN7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLCO4C1Q6ZQN7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLCO4C1Q6ZQN7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLCO4C1Q6ZQN7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLCO4C1Q6ZQN7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLCO4C1Q6ZQN7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLCO4C1Q6ZQN7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLCO4C1Q6ZQN7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLCO4C1Q6ZQN7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLCO4C1Q6ZQN7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLCO4C1Q6ZQN7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLCO4C1Q6ZQN7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLCO4C1Q6ZQN7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLCO4C1Q6ZQN7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLCO4C1Q6ZQN7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLCO4C1Q6ZQN7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLCO4C1Q6ZQN7 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLCO4C1Q6ZQN7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SLCO4C1Q6ZQN7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLCO4C1Q6ZQN7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLCO4C1Q6ZQN7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLCO4C1Q6ZQN7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLCO4C1Q6ZQN7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLCO4C1Q6ZQN7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLCO4C1Q6ZQN7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLCO4C1Q6ZQN7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SLCO4C1Q6ZQN7 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLCO4C1Q6ZQN7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLCO4C1Q6ZQN7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLCO4C1Q6ZQN7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLCO4C1Q6ZQN7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLCO4C1Q6ZQN7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLCO4C1Q6ZQN7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLCO4C1Q6ZQN7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLCO4C1Q6ZQN7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLCO4C1Q6ZQN7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLCO4C1Q6ZQN7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLCO4C1Q6ZQN7 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLCO4C1Q6ZQN7 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SLCO4C1Q6ZQN7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLCO4C1Q6ZQN7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLCO4C1Q6ZQN7 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLCO4C1Q6ZQN7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLCO4C1Q6ZQN7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLCO4C1Q6ZQN7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLCO4C1Q6ZQN7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLCO4C1Q6ZQN7 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SLCO4C1Q6ZQN7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLCO4C1Q6ZQN7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLCO4C1Q6ZQN7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLCO4C1Q6ZQN7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLCO4C1Q6ZQN7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLCO4C1Q6ZQN7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLCO4C1Q6ZQN7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLCO4C1Q6ZQN7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLCO4C1Q6ZQN7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLCO4C1Q6ZQN7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLCO4C1Q6ZQN7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLCO4C1Q6ZQN7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLCO4C1Q6ZQN7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLCO4C1Q6ZQN7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLCO4C1Q6ZQN7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SLCO4C1Q6ZQN7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLCO4C1Q6ZQN7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLCO4C1Q6ZQN7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLCO4C1Q6ZQN7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLCO4C1Q6ZQN7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLCO4C1Q6ZQN7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLCO4C1Q6ZQN7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLCO4C1Q6ZQN7 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLCO4C1Q6ZQN7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLCO4C1Q6ZQN7 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SLCO4C1Q6ZQN7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLCO4C1Q6ZQN7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLCO4C1Q6ZQN7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SLCO4C1Q6ZQN7 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLCO4C1Q6ZQN7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
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