Protein–RNA interactions for Protein: Q6VVB1

NHLRC1, E3 ubiquitin-protein ligase NHLRC1, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLRC1Q6VVB1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NHLRC1Q6VVB1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NHLRC1Q6VVB1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NHLRC1Q6VVB1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NHLRC1Q6VVB1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NHLRC1Q6VVB1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NHLRC1Q6VVB1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NHLRC1Q6VVB1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NHLRC1Q6VVB1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NHLRC1Q6VVB1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NHLRC1Q6VVB1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NHLRC1Q6VVB1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NHLRC1Q6VVB1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NHLRC1Q6VVB1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NHLRC1Q6VVB1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NHLRC1Q6VVB1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NHLRC1Q6VVB1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NHLRC1Q6VVB1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NHLRC1Q6VVB1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NHLRC1Q6VVB1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NHLRC1Q6VVB1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NHLRC1Q6VVB1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NHLRC1Q6VVB1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NHLRC1Q6VVB1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NHLRC1Q6VVB1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NHLRC1Q6VVB1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NHLRC1Q6VVB1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NHLRC1Q6VVB1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NHLRC1Q6VVB1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NHLRC1Q6VVB1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
NHLRC1Q6VVB1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NHLRC1Q6VVB1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NHLRC1Q6VVB1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NHLRC1Q6VVB1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NHLRC1Q6VVB1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NHLRC1Q6VVB1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NHLRC1Q6VVB1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NHLRC1Q6VVB1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NHLRC1Q6VVB1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NHLRC1Q6VVB1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NHLRC1Q6VVB1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NHLRC1Q6VVB1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NHLRC1Q6VVB1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NHLRC1Q6VVB1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NHLRC1Q6VVB1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NHLRC1Q6VVB1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NHLRC1Q6VVB1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NHLRC1Q6VVB1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NHLRC1Q6VVB1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NHLRC1Q6VVB1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NHLRC1Q6VVB1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NHLRC1Q6VVB1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NHLRC1Q6VVB1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NHLRC1Q6VVB1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NHLRC1Q6VVB1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NHLRC1Q6VVB1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NHLRC1Q6VVB1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NHLRC1Q6VVB1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NHLRC1Q6VVB1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NHLRC1Q6VVB1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NHLRC1Q6VVB1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NHLRC1Q6VVB1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NHLRC1Q6VVB1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NHLRC1Q6VVB1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NHLRC1Q6VVB1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NHLRC1Q6VVB1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NHLRC1Q6VVB1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NHLRC1Q6VVB1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NHLRC1Q6VVB1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NHLRC1Q6VVB1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NHLRC1Q6VVB1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NHLRC1Q6VVB1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NHLRC1Q6VVB1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NHLRC1Q6VVB1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NHLRC1Q6VVB1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
NHLRC1Q6VVB1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NHLRC1Q6VVB1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NHLRC1Q6VVB1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NHLRC1Q6VVB1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NHLRC1Q6VVB1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NHLRC1Q6VVB1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NHLRC1Q6VVB1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NHLRC1Q6VVB1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NHLRC1Q6VVB1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NHLRC1Q6VVB1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NHLRC1Q6VVB1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NHLRC1Q6VVB1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NHLRC1Q6VVB1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NHLRC1Q6VVB1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NHLRC1Q6VVB1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NHLRC1Q6VVB1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NHLRC1Q6VVB1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NHLRC1Q6VVB1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NHLRC1Q6VVB1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NHLRC1Q6VVB1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NHLRC1Q6VVB1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NHLRC1Q6VVB1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NHLRC1Q6VVB1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NHLRC1Q6VVB1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NHLRC1Q6VVB1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms