Protein–RNA interactions for Protein: Q6PP77

XKRX, XK-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XKRXQ6PP77 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
XKRXQ6PP77 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
XKRXQ6PP77 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
XKRXQ6PP77 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
XKRXQ6PP77 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
XKRXQ6PP77 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
XKRXQ6PP77 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
XKRXQ6PP77 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
XKRXQ6PP77 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
XKRXQ6PP77 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
XKRXQ6PP77 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
XKRXQ6PP77 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
XKRXQ6PP77 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
XKRXQ6PP77 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
XKRXQ6PP77 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
XKRXQ6PP77 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
XKRXQ6PP77 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
XKRXQ6PP77 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
XKRXQ6PP77 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
XKRXQ6PP77 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
XKRXQ6PP77 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
XKRXQ6PP77 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
XKRXQ6PP77 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
XKRXQ6PP77 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
XKRXQ6PP77 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
XKRXQ6PP77 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
XKRXQ6PP77 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
XKRXQ6PP77 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
XKRXQ6PP77 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
XKRXQ6PP77 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
XKRXQ6PP77 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
XKRXQ6PP77 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
XKRXQ6PP77 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
XKRXQ6PP77 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
XKRXQ6PP77 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
XKRXQ6PP77 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
XKRXQ6PP77 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
XKRXQ6PP77 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
XKRXQ6PP77 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
XKRXQ6PP77 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
XKRXQ6PP77 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
XKRXQ6PP77 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
XKRXQ6PP77 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
XKRXQ6PP77 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
XKRXQ6PP77 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
XKRXQ6PP77 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24■■□□□ 1.43
XKRXQ6PP77 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
XKRXQ6PP77 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
XKRXQ6PP77 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
XKRXQ6PP77 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
XKRXQ6PP77 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
XKRXQ6PP77 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
XKRXQ6PP77 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
XKRXQ6PP77 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
XKRXQ6PP77 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
XKRXQ6PP77 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
XKRXQ6PP77 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
XKRXQ6PP77 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
XKRXQ6PP77 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
XKRXQ6PP77 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
XKRXQ6PP77 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
XKRXQ6PP77 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
XKRXQ6PP77 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
XKRXQ6PP77 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
XKRXQ6PP77 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
XKRXQ6PP77 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
XKRXQ6PP77 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
XKRXQ6PP77 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
XKRXQ6PP77 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
XKRXQ6PP77 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
XKRXQ6PP77 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
XKRXQ6PP77 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
XKRXQ6PP77 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
XKRXQ6PP77 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
XKRXQ6PP77 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
XKRXQ6PP77 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
XKRXQ6PP77 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
XKRXQ6PP77 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
XKRXQ6PP77 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
XKRXQ6PP77 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
XKRXQ6PP77 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
XKRXQ6PP77 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
XKRXQ6PP77 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
XKRXQ6PP77 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
XKRXQ6PP77 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
XKRXQ6PP77 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
XKRXQ6PP77 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
XKRXQ6PP77 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
XKRXQ6PP77 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
XKRXQ6PP77 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
XKRXQ6PP77 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
XKRXQ6PP77 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
XKRXQ6PP77 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
XKRXQ6PP77 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
XKRXQ6PP77 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
XKRXQ6PP77 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
XKRXQ6PP77 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
XKRXQ6PP77 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
XKRXQ6PP77 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
XKRXQ6PP77 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.5 ms