Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVS0

C1orf140, Putative uncharacterized protein C1orf140, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf140Q5VVS0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
C1orf140Q5VVS0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
C1orf140Q5VVS0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
C1orf140Q5VVS0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
C1orf140Q5VVS0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
C1orf140Q5VVS0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
C1orf140Q5VVS0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
C1orf140Q5VVS0 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
C1orf140Q5VVS0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
C1orf140Q5VVS0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
C1orf140Q5VVS0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
C1orf140Q5VVS0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
C1orf140Q5VVS0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
C1orf140Q5VVS0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
C1orf140Q5VVS0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
C1orf140Q5VVS0 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C1orf140Q5VVS0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C1orf140Q5VVS0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C1orf140Q5VVS0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
C1orf140Q5VVS0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C1orf140Q5VVS0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
C1orf140Q5VVS0 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
C1orf140Q5VVS0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C1orf140Q5VVS0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
C1orf140Q5VVS0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C1orf140Q5VVS0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C1orf140Q5VVS0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
C1orf140Q5VVS0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C1orf140Q5VVS0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
C1orf140Q5VVS0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
C1orf140Q5VVS0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C1orf140Q5VVS0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C1orf140Q5VVS0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
C1orf140Q5VVS0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C1orf140Q5VVS0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C1orf140Q5VVS0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C1orf140Q5VVS0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
C1orf140Q5VVS0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
C1orf140Q5VVS0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
C1orf140Q5VVS0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
C1orf140Q5VVS0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C1orf140Q5VVS0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C1orf140Q5VVS0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C1orf140Q5VVS0 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
C1orf140Q5VVS0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C1orf140Q5VVS0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
C1orf140Q5VVS0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C1orf140Q5VVS0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C1orf140Q5VVS0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C1orf140Q5VVS0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C1orf140Q5VVS0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C1orf140Q5VVS0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
C1orf140Q5VVS0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C1orf140Q5VVS0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C1orf140Q5VVS0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C1orf140Q5VVS0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C1orf140Q5VVS0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C1orf140Q5VVS0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
C1orf140Q5VVS0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
C1orf140Q5VVS0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
C1orf140Q5VVS0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
C1orf140Q5VVS0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
C1orf140Q5VVS0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
C1orf140Q5VVS0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
C1orf140Q5VVS0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C1orf140Q5VVS0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C1orf140Q5VVS0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
C1orf140Q5VVS0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C1orf140Q5VVS0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C1orf140Q5VVS0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C1orf140Q5VVS0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C1orf140Q5VVS0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C1orf140Q5VVS0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C1orf140Q5VVS0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C1orf140Q5VVS0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C1orf140Q5VVS0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
C1orf140Q5VVS0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C1orf140Q5VVS0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
C1orf140Q5VVS0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C1orf140Q5VVS0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C1orf140Q5VVS0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C1orf140Q5VVS0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C1orf140Q5VVS0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C1orf140Q5VVS0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C1orf140Q5VVS0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C1orf140Q5VVS0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C1orf140Q5VVS0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C1orf140Q5VVS0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
C1orf140Q5VVS0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C1orf140Q5VVS0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C1orf140Q5VVS0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C1orf140Q5VVS0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C1orf140Q5VVS0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C1orf140Q5VVS0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C1orf140Q5VVS0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C1orf140Q5VVS0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C1orf140Q5VVS0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C1orf140Q5VVS0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C1orf140Q5VVS0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C1orf140Q5VVS0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms