Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTM2

AGAP9, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP9Q5VTM2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
AGAP9Q5VTM2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
AGAP9Q5VTM2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
AGAP9Q5VTM2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
AGAP9Q5VTM2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
AGAP9Q5VTM2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
AGAP9Q5VTM2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
AGAP9Q5VTM2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
AGAP9Q5VTM2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
AGAP9Q5VTM2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
AGAP9Q5VTM2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
AGAP9Q5VTM2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
AGAP9Q5VTM2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
AGAP9Q5VTM2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
AGAP9Q5VTM2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
AGAP9Q5VTM2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
AGAP9Q5VTM2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
AGAP9Q5VTM2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
AGAP9Q5VTM2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
AGAP9Q5VTM2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
AGAP9Q5VTM2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
AGAP9Q5VTM2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
AGAP9Q5VTM2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
AGAP9Q5VTM2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
AGAP9Q5VTM2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
AGAP9Q5VTM2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
AGAP9Q5VTM2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
AGAP9Q5VTM2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
AGAP9Q5VTM2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
AGAP9Q5VTM2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
AGAP9Q5VTM2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
AGAP9Q5VTM2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
AGAP9Q5VTM2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
AGAP9Q5VTM2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
AGAP9Q5VTM2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
AGAP9Q5VTM2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
AGAP9Q5VTM2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
AGAP9Q5VTM2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
AGAP9Q5VTM2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
AGAP9Q5VTM2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
AGAP9Q5VTM2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
AGAP9Q5VTM2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
AGAP9Q5VTM2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
AGAP9Q5VTM2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
AGAP9Q5VTM2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
AGAP9Q5VTM2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
AGAP9Q5VTM2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
AGAP9Q5VTM2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
AGAP9Q5VTM2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
AGAP9Q5VTM2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
AGAP9Q5VTM2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
AGAP9Q5VTM2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
AGAP9Q5VTM2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
AGAP9Q5VTM2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
AGAP9Q5VTM2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
AGAP9Q5VTM2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
AGAP9Q5VTM2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
AGAP9Q5VTM2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
AGAP9Q5VTM2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
AGAP9Q5VTM2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
AGAP9Q5VTM2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
AGAP9Q5VTM2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
AGAP9Q5VTM2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
AGAP9Q5VTM2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
AGAP9Q5VTM2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
AGAP9Q5VTM2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
AGAP9Q5VTM2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
AGAP9Q5VTM2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
AGAP9Q5VTM2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
AGAP9Q5VTM2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
AGAP9Q5VTM2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
AGAP9Q5VTM2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
AGAP9Q5VTM2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
AGAP9Q5VTM2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
AGAP9Q5VTM2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
AGAP9Q5VTM2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
AGAP9Q5VTM2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
AGAP9Q5VTM2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
AGAP9Q5VTM2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
AGAP9Q5VTM2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
AGAP9Q5VTM2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
AGAP9Q5VTM2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
AGAP9Q5VTM2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
AGAP9Q5VTM2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
AGAP9Q5VTM2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
AGAP9Q5VTM2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
AGAP9Q5VTM2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
AGAP9Q5VTM2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
AGAP9Q5VTM2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
AGAP9Q5VTM2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
AGAP9Q5VTM2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
AGAP9Q5VTM2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
AGAP9Q5VTM2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
AGAP9Q5VTM2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
AGAP9Q5VTM2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
AGAP9Q5VTM2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
AGAP9Q5VTM2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
AGAP9Q5VTM2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
AGAP9Q5VTM2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
AGAP9Q5VTM2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms