Protein–RNA interactions for Protein: Q5HYW3

RTL5, Retrotransposon Gag-like protein 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 569 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL5Q5HYW3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
RTL5Q5HYW3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
RTL5Q5HYW3 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
RTL5Q5HYW3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
RTL5Q5HYW3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
RTL5Q5HYW3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
RTL5Q5HYW3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
RTL5Q5HYW3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC33.82■■■■□ 3
RTL5Q5HYW3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
RTL5Q5HYW3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
RTL5Q5HYW3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
RTL5Q5HYW3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC33.8■■■■□ 3
RTL5Q5HYW3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC33.8■■■■□ 3
RTL5Q5HYW3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
RTL5Q5HYW3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
RTL5Q5HYW3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
RTL5Q5HYW3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
RTL5Q5HYW3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
RTL5Q5HYW3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
RTL5Q5HYW3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
RTL5Q5HYW3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
RTL5Q5HYW3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
RTL5Q5HYW3 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC33.79■■■■□ 3
RTL5Q5HYW3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
RTL5Q5HYW3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
RTL5Q5HYW3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
RTL5Q5HYW3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
RTL5Q5HYW3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC33.74■■■□□ 2.99
RTL5Q5HYW3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
RTL5Q5HYW3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
RTL5Q5HYW3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
RTL5Q5HYW3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
RTL5Q5HYW3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
RTL5Q5HYW3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
RTL5Q5HYW3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
RTL5Q5HYW3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC33.71■■■□□ 2.99
RTL5Q5HYW3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
RTL5Q5HYW3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
RTL5Q5HYW3 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
RTL5Q5HYW3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
RTL5Q5HYW3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
RTL5Q5HYW3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
RTL5Q5HYW3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
RTL5Q5HYW3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
RTL5Q5HYW3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
RTL5Q5HYW3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
RTL5Q5HYW3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
RTL5Q5HYW3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
RTL5Q5HYW3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
RTL5Q5HYW3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
RTL5Q5HYW3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
RTL5Q5HYW3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
RTL5Q5HYW3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
RTL5Q5HYW3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
RTL5Q5HYW3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
RTL5Q5HYW3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
RTL5Q5HYW3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
RTL5Q5HYW3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
RTL5Q5HYW3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
RTL5Q5HYW3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
RTL5Q5HYW3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
RTL5Q5HYW3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
RTL5Q5HYW3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
RTL5Q5HYW3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
RTL5Q5HYW3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
RTL5Q5HYW3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
RTL5Q5HYW3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
RTL5Q5HYW3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
RTL5Q5HYW3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
RTL5Q5HYW3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
RTL5Q5HYW3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
RTL5Q5HYW3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
RTL5Q5HYW3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
RTL5Q5HYW3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
RTL5Q5HYW3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
RTL5Q5HYW3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC33.53■■■□□ 2.96
RTL5Q5HYW3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
RTL5Q5HYW3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
RTL5Q5HYW3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
RTL5Q5HYW3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
RTL5Q5HYW3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
RTL5Q5HYW3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC33.51■■■□□ 2.95
RTL5Q5HYW3 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
RTL5Q5HYW3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
RTL5Q5HYW3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
RTL5Q5HYW3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
RTL5Q5HYW3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
RTL5Q5HYW3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
RTL5Q5HYW3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
RTL5Q5HYW3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC33.46■■■□□ 2.95
RTL5Q5HYW3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
RTL5Q5HYW3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
RTL5Q5HYW3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
RTL5Q5HYW3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.94
RTL5Q5HYW3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
RTL5Q5HYW3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
RTL5Q5HYW3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
RTL5Q5HYW3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
RTL5Q5HYW3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
RTL5Q5HYW3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.4 ms