Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CACNA1CQ13936 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CACNA1CQ13936 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CACNA1CQ13936 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CACNA1CQ13936 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CACNA1CQ13936 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CACNA1CQ13936 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CACNA1CQ13936 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CACNA1CQ13936 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CACNA1CQ13936 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CACNA1CQ13936 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CACNA1CQ13936 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CACNA1CQ13936 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CACNA1CQ13936 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CACNA1CQ13936 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CACNA1CQ13936 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CACNA1CQ13936 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CACNA1CQ13936 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CACNA1CQ13936 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CACNA1CQ13936 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CACNA1CQ13936 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CACNA1CQ13936 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CACNA1CQ13936 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CACNA1CQ13936 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CACNA1CQ13936 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CACNA1CQ13936 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CACNA1CQ13936 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CACNA1CQ13936 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CACNA1CQ13936 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CACNA1CQ13936 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CACNA1CQ13936 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CACNA1CQ13936 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CACNA1CQ13936 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CACNA1CQ13936 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CACNA1CQ13936 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CACNA1CQ13936 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CACNA1CQ13936 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CACNA1CQ13936 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CACNA1CQ13936 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CACNA1CQ13936 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CACNA1CQ13936 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CACNA1CQ13936 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CACNA1CQ13936 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CACNA1CQ13936 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CACNA1CQ13936 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CACNA1CQ13936 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CACNA1CQ13936 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CACNA1CQ13936 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CACNA1CQ13936 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CACNA1CQ13936 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CACNA1CQ13936 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CACNA1CQ13936 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CACNA1CQ13936 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CACNA1CQ13936 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CACNA1CQ13936 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CACNA1CQ13936 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CACNA1CQ13936 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CACNA1CQ13936 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CACNA1CQ13936 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CACNA1CQ13936 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CACNA1CQ13936 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CACNA1CQ13936 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CACNA1CQ13936 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CACNA1CQ13936 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CACNA1CQ13936 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CACNA1CQ13936 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CACNA1CQ13936 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CACNA1CQ13936 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CACNA1CQ13936 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CACNA1CQ13936 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CACNA1CQ13936 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CACNA1CQ13936 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CACNA1CQ13936 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CACNA1CQ13936 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CACNA1CQ13936 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CACNA1CQ13936 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CACNA1CQ13936 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CACNA1CQ13936 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CACNA1CQ13936 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CACNA1CQ13936 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CACNA1CQ13936 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CACNA1CQ13936 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CACNA1CQ13936 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CACNA1CQ13936 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CACNA1CQ13936 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CACNA1CQ13936 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CACNA1CQ13936 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CACNA1CQ13936 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CACNA1CQ13936 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CACNA1CQ13936 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CACNA1CQ13936 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CACNA1CQ13936 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CACNA1CQ13936 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CACNA1CQ13936 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CACNA1CQ13936 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CACNA1CQ13936 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CACNA1CQ13936 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CACNA1CQ13936 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CACNA1CQ13936 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CACNA1CQ13936 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
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