Protein–RNA interactions for Protein: P57678

GEMIN4, Gem-associated protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,058 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEMIN4P57678 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GEMIN4P57678 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GEMIN4P57678 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GEMIN4P57678 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GEMIN4P57678 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GEMIN4P57678 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
GEMIN4P57678 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GEMIN4P57678 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GEMIN4P57678 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
GEMIN4P57678 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GEMIN4P57678 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GEMIN4P57678 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GEMIN4P57678 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GEMIN4P57678 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GEMIN4P57678 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GEMIN4P57678 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GEMIN4P57678 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GEMIN4P57678 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GEMIN4P57678 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GEMIN4P57678 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GEMIN4P57678 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GEMIN4P57678 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GEMIN4P57678 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GEMIN4P57678 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
GEMIN4P57678 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GEMIN4P57678 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GEMIN4P57678 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
GEMIN4P57678 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GEMIN4P57678 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GEMIN4P57678 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GEMIN4P57678 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GEMIN4P57678 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GEMIN4P57678 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GEMIN4P57678 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GEMIN4P57678 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
GEMIN4P57678 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GEMIN4P57678 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GEMIN4P57678 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GEMIN4P57678 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GEMIN4P57678 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GEMIN4P57678 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
GEMIN4P57678 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GEMIN4P57678 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GEMIN4P57678 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GEMIN4P57678 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GEMIN4P57678 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GEMIN4P57678 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GEMIN4P57678 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GEMIN4P57678 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GEMIN4P57678 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GEMIN4P57678 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GEMIN4P57678 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GEMIN4P57678 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GEMIN4P57678 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GEMIN4P57678 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GEMIN4P57678 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GEMIN4P57678 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GEMIN4P57678 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GEMIN4P57678 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GEMIN4P57678 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GEMIN4P57678 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
GEMIN4P57678 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GEMIN4P57678 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GEMIN4P57678 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GEMIN4P57678 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GEMIN4P57678 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GEMIN4P57678 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GEMIN4P57678 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GEMIN4P57678 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GEMIN4P57678 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GEMIN4P57678 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GEMIN4P57678 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GEMIN4P57678 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GEMIN4P57678 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GEMIN4P57678 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GEMIN4P57678 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GEMIN4P57678 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
GEMIN4P57678 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
GEMIN4P57678 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GEMIN4P57678 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GEMIN4P57678 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GEMIN4P57678 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GEMIN4P57678 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GEMIN4P57678 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GEMIN4P57678 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
GEMIN4P57678 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GEMIN4P57678 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GEMIN4P57678 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GEMIN4P57678 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GEMIN4P57678 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GEMIN4P57678 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GEMIN4P57678 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GEMIN4P57678 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GEMIN4P57678 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GEMIN4P57678 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GEMIN4P57678 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GEMIN4P57678 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GEMIN4P57678 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GEMIN4P57678 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GEMIN4P57678 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms