Protein–RNA interactions for Protein: P53992

SEC24C, Protein transport protein Sec24C, humanhuman

Predictions only

Length 1,094 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24CP53992 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SEC24CP53992 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SEC24CP53992 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SEC24CP53992 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SEC24CP53992 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SEC24CP53992 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SEC24CP53992 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SEC24CP53992 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SEC24CP53992 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SEC24CP53992 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SEC24CP53992 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SEC24CP53992 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SEC24CP53992 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SEC24CP53992 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SEC24CP53992 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SEC24CP53992 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SEC24CP53992 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SEC24CP53992 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SEC24CP53992 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SEC24CP53992 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SEC24CP53992 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SEC24CP53992 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SEC24CP53992 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SEC24CP53992 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SEC24CP53992 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
SEC24CP53992 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SEC24CP53992 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SEC24CP53992 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SEC24CP53992 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SEC24CP53992 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SEC24CP53992 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SEC24CP53992 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SEC24CP53992 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SEC24CP53992 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SEC24CP53992 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SEC24CP53992 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SEC24CP53992 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SEC24CP53992 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SEC24CP53992 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SEC24CP53992 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SEC24CP53992 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SEC24CP53992 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SEC24CP53992 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SEC24CP53992 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SEC24CP53992 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SEC24CP53992 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SEC24CP53992 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SEC24CP53992 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SEC24CP53992 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SEC24CP53992 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SEC24CP53992 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SEC24CP53992 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SEC24CP53992 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SEC24CP53992 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SEC24CP53992 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SEC24CP53992 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SEC24CP53992 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SEC24CP53992 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SEC24CP53992 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SEC24CP53992 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SEC24CP53992 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SEC24CP53992 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SEC24CP53992 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SEC24CP53992 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SEC24CP53992 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SEC24CP53992 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SEC24CP53992 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SEC24CP53992 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SEC24CP53992 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SEC24CP53992 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SEC24CP53992 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SEC24CP53992 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SEC24CP53992 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SEC24CP53992 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SEC24CP53992 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SEC24CP53992 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
SEC24CP53992 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SEC24CP53992 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SEC24CP53992 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SEC24CP53992 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SEC24CP53992 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SEC24CP53992 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SEC24CP53992 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SEC24CP53992 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SEC24CP53992 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SEC24CP53992 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SEC24CP53992 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SEC24CP53992 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SEC24CP53992 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SEC24CP53992 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SEC24CP53992 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SEC24CP53992 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SEC24CP53992 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SEC24CP53992 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SEC24CP53992 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SEC24CP53992 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SEC24CP53992 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SEC24CP53992 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SEC24CP53992 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SEC24CP53992 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms