Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
HOXD13P35453 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
HOXD13P35453 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
HOXD13P35453 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
HOXD13P35453 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
HOXD13P35453 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
HOXD13P35453 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
HOXD13P35453 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
HOXD13P35453 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
HOXD13P35453 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
HOXD13P35453 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
HOXD13P35453 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
HOXD13P35453 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.97■■■□□ 2.23
HOXD13P35453 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
HOXD13P35453 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
HOXD13P35453 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.96■■■□□ 2.23
HOXD13P35453 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
HOXD13P35453 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
HOXD13P35453 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
HOXD13P35453 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
HOXD13P35453 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
HOXD13P35453 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
HOXD13P35453 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
HOXD13P35453 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
HOXD13P35453 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
HOXD13P35453 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
HOXD13P35453 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
HOXD13P35453 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
HOXD13P35453 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
HOXD13P35453 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
HOXD13P35453 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
HOXD13P35453 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
HOXD13P35453 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
HOXD13P35453 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
HOXD13P35453 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
HOXD13P35453 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
HOXD13P35453 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
HOXD13P35453 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
HOXD13P35453 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
HOXD13P35453 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
HOXD13P35453 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
HOXD13P35453 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
HOXD13P35453 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
HOXD13P35453 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
HOXD13P35453 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
HOXD13P35453 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
HOXD13P35453 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
HOXD13P35453 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
HOXD13P35453 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
HOXD13P35453 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
HOXD13P35453 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
HOXD13P35453 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
HOXD13P35453 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
HOXD13P35453 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
HOXD13P35453 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
HOXD13P35453 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
HOXD13P35453 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
HOXD13P35453 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
HOXD13P35453 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
HOXD13P35453 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
HOXD13P35453 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
HOXD13P35453 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
HOXD13P35453 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
HOXD13P35453 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
HOXD13P35453 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
HOXD13P35453 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
HOXD13P35453 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
HOXD13P35453 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
HOXD13P35453 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
HOXD13P35453 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
HOXD13P35453 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
HOXD13P35453 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
HOXD13P35453 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
HOXD13P35453 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
HOXD13P35453 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
HOXD13P35453 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
HOXD13P35453 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
HOXD13P35453 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
HOXD13P35453 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
HOXD13P35453 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
HOXD13P35453 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
HOXD13P35453 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
HOXD13P35453 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
HOXD13P35453 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
HOXD13P35453 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
HOXD13P35453 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
HOXD13P35453 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
HOXD13P35453 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
HOXD13P35453 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
HOXD13P35453 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
HOXD13P35453 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
HOXD13P35453 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
HOXD13P35453 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
HOXD13P35453 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
HOXD13P35453 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
HOXD13P35453 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
HOXD13P35453 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
HOXD13P35453 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
HOXD13P35453 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
HOXD13P35453 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms