Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC37.52■■■■□ 3.6
HOXD13P35453 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
HOXD13P35453 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC36.66■■■■□ 3.46
HOXD13P35453 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
HOXD13P35453 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
HOXD13P35453 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
HOXD13P35453 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
HOXD13P35453 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
HOXD13P35453 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
HOXD13P35453 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC35.73■■■■□ 3.31
HOXD13P35453 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
HOXD13P35453 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
HOXD13P35453 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
HOXD13P35453 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
HOXD13P35453 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.01■■■■□ 3.2
HOXD13P35453 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC34.83■■■■□ 3.17
HOXD13P35453 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
HOXD13P35453 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
HOXD13P35453 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
HOXD13P35453 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
HOXD13P35453 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
HOXD13P35453 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC34.41■■■■□ 3.1
HOXD13P35453 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
HOXD13P35453 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
HOXD13P35453 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
HOXD13P35453 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
HOXD13P35453 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
HOXD13P35453 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
HOXD13P35453 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC34.03■■■■□ 3.04
HOXD13P35453 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
HOXD13P35453 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
HOXD13P35453 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
HOXD13P35453 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
HOXD13P35453 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
HOXD13P35453 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
HOXD13P35453 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
HOXD13P35453 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
HOXD13P35453 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
HOXD13P35453 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
HOXD13P35453 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC33.33■■■□□ 2.93
HOXD13P35453 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
HOXD13P35453 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
HOXD13P35453 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
HOXD13P35453 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
HOXD13P35453 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
HOXD13P35453 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
HOXD13P35453 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
HOXD13P35453 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
HOXD13P35453 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
HOXD13P35453 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
HOXD13P35453 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
HOXD13P35453 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
HOXD13P35453 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
HOXD13P35453 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
HOXD13P35453 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
HOXD13P35453 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
HOXD13P35453 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
HOXD13P35453 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
HOXD13P35453 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
HOXD13P35453 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
HOXD13P35453 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
HOXD13P35453 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
HOXD13P35453 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
HOXD13P35453 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
HOXD13P35453 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
HOXD13P35453 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
HOXD13P35453 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
HOXD13P35453 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
HOXD13P35453 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
HOXD13P35453 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
HOXD13P35453 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
HOXD13P35453 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
HOXD13P35453 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
HOXD13P35453 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC32.33■■■□□ 2.77
HOXD13P35453 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
HOXD13P35453 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
HOXD13P35453 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
HOXD13P35453 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
HOXD13P35453 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
HOXD13P35453 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
HOXD13P35453 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
HOXD13P35453 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
HOXD13P35453 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
HOXD13P35453 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
HOXD13P35453 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
HOXD13P35453 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
HOXD13P35453 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
HOXD13P35453 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
HOXD13P35453 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
HOXD13P35453 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
HOXD13P35453 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
HOXD13P35453 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
HOXD13P35453 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
HOXD13P35453 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC31.88■■■□□ 2.69
HOXD13P35453 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
HOXD13P35453 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC31.86■■■□□ 2.69
HOXD13P35453 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
HOXD13P35453 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
HOXD13P35453 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC31.77■■■□□ 2.68
HOXD13P35453 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 161.3 ms