Protein–RNA interactions for Protein: P18615

NELFE, Negative elongation factor E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 380 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFEP18615 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NELFEP18615 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NELFEP18615 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NELFEP18615 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NELFEP18615 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NELFEP18615 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NELFEP18615 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NELFEP18615 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NELFEP18615 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NELFEP18615 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NELFEP18615 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NELFEP18615 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NELFEP18615 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NELFEP18615 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NELFEP18615 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NELFEP18615 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NELFEP18615 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NELFEP18615 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NELFEP18615 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NELFEP18615 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NELFEP18615 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NELFEP18615 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NELFEP18615 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NELFEP18615 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NELFEP18615 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NELFEP18615 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NELFEP18615 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NELFEP18615 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NELFEP18615 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NELFEP18615 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NELFEP18615 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NELFEP18615 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NELFEP18615 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NELFEP18615 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NELFEP18615 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
NELFEP18615 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NELFEP18615 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NELFEP18615 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
NELFEP18615 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NELFEP18615 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NELFEP18615 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NELFEP18615 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NELFEP18615 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NELFEP18615 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NELFEP18615 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NELFEP18615 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NELFEP18615 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NELFEP18615 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
NELFEP18615 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NELFEP18615 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NELFEP18615 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
NELFEP18615 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
NELFEP18615 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NELFEP18615 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NELFEP18615 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NELFEP18615 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NELFEP18615 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NELFEP18615 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NELFEP18615 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NELFEP18615 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NELFEP18615 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NELFEP18615 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NELFEP18615 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
NELFEP18615 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NELFEP18615 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NELFEP18615 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NELFEP18615 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NELFEP18615 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NELFEP18615 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NELFEP18615 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NELFEP18615 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NELFEP18615 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NELFEP18615 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NELFEP18615 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NELFEP18615 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NELFEP18615 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NELFEP18615 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NELFEP18615 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
NELFEP18615 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NELFEP18615 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NELFEP18615 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NELFEP18615 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NELFEP18615 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NELFEP18615 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NELFEP18615 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NELFEP18615 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NELFEP18615 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NELFEP18615 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NELFEP18615 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NELFEP18615 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NELFEP18615 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NELFEP18615 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NELFEP18615 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NELFEP18615 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NELFEP18615 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NELFEP18615 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NELFEP18615 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NELFEP18615 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NELFEP18615 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NELFEP18615 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
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