Protein–RNA interactions for Protein: O94788

ALDH1A2, Retinal dehydrogenase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH1A2O94788 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ALDH1A2O94788 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ALDH1A2O94788 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ALDH1A2O94788 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
ALDH1A2O94788 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ALDH1A2O94788 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ALDH1A2O94788 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ALDH1A2O94788 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ALDH1A2O94788 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ALDH1A2O94788 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ALDH1A2O94788 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ALDH1A2O94788 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ALDH1A2O94788 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ALDH1A2O94788 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ALDH1A2O94788 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ALDH1A2O94788 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
ALDH1A2O94788 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ALDH1A2O94788 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ALDH1A2O94788 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ALDH1A2O94788 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
ALDH1A2O94788 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ALDH1A2O94788 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ALDH1A2O94788 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ALDH1A2O94788 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ALDH1A2O94788 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ALDH1A2O94788 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ALDH1A2O94788 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ALDH1A2O94788 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ALDH1A2O94788 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ALDH1A2O94788 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ALDH1A2O94788 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ALDH1A2O94788 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ALDH1A2O94788 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ALDH1A2O94788 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ALDH1A2O94788 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ALDH1A2O94788 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ALDH1A2O94788 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ALDH1A2O94788 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ALDH1A2O94788 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ALDH1A2O94788 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
ALDH1A2O94788 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
ALDH1A2O94788 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ALDH1A2O94788 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ALDH1A2O94788 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ALDH1A2O94788 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ALDH1A2O94788 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ALDH1A2O94788 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ALDH1A2O94788 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ALDH1A2O94788 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ALDH1A2O94788 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ALDH1A2O94788 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ALDH1A2O94788 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
ALDH1A2O94788 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ALDH1A2O94788 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ALDH1A2O94788 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ALDH1A2O94788 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ALDH1A2O94788 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ALDH1A2O94788 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ALDH1A2O94788 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ALDH1A2O94788 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ALDH1A2O94788 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ALDH1A2O94788 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ALDH1A2O94788 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ALDH1A2O94788 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ALDH1A2O94788 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ALDH1A2O94788 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ALDH1A2O94788 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
ALDH1A2O94788 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ALDH1A2O94788 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ALDH1A2O94788 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ALDH1A2O94788 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ALDH1A2O94788 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
ALDH1A2O94788 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ALDH1A2O94788 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ALDH1A2O94788 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ALDH1A2O94788 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ALDH1A2O94788 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ALDH1A2O94788 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
ALDH1A2O94788 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
ALDH1A2O94788 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ALDH1A2O94788 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ALDH1A2O94788 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ALDH1A2O94788 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ALDH1A2O94788 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ALDH1A2O94788 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ALDH1A2O94788 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ALDH1A2O94788 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ALDH1A2O94788 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ALDH1A2O94788 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ALDH1A2O94788 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ALDH1A2O94788 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
ALDH1A2O94788 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ALDH1A2O94788 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ALDH1A2O94788 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ALDH1A2O94788 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ALDH1A2O94788 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ALDH1A2O94788 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ALDH1A2O94788 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ALDH1A2O94788 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ALDH1A2O94788 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms