Protein–RNA interactions for Protein: O75901

RASSF9, Ras association domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF9O75901 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RASSF9O75901 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RASSF9O75901 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
RASSF9O75901 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RASSF9O75901 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RASSF9O75901 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RASSF9O75901 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RASSF9O75901 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RASSF9O75901 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RASSF9O75901 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RASSF9O75901 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RASSF9O75901 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RASSF9O75901 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RASSF9O75901 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RASSF9O75901 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
RASSF9O75901 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RASSF9O75901 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RASSF9O75901 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RASSF9O75901 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RASSF9O75901 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RASSF9O75901 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RASSF9O75901 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RASSF9O75901 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RASSF9O75901 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RASSF9O75901 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RASSF9O75901 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RASSF9O75901 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RASSF9O75901 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RASSF9O75901 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RASSF9O75901 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RASSF9O75901 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RASSF9O75901 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
RASSF9O75901 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RASSF9O75901 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RASSF9O75901 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RASSF9O75901 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RASSF9O75901 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RASSF9O75901 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RASSF9O75901 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RASSF9O75901 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RASSF9O75901 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RASSF9O75901 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RASSF9O75901 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RASSF9O75901 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RASSF9O75901 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RASSF9O75901 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RASSF9O75901 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RASSF9O75901 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
RASSF9O75901 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RASSF9O75901 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RASSF9O75901 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RASSF9O75901 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RASSF9O75901 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RASSF9O75901 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RASSF9O75901 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RASSF9O75901 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RASSF9O75901 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RASSF9O75901 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RASSF9O75901 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
RASSF9O75901 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RASSF9O75901 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
RASSF9O75901 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RASSF9O75901 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RASSF9O75901 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RASSF9O75901 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
RASSF9O75901 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
RASSF9O75901 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RASSF9O75901 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RASSF9O75901 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RASSF9O75901 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RASSF9O75901 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RASSF9O75901 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RASSF9O75901 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RASSF9O75901 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RASSF9O75901 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RASSF9O75901 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RASSF9O75901 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RASSF9O75901 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RASSF9O75901 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RASSF9O75901 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RASSF9O75901 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RASSF9O75901 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
RASSF9O75901 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RASSF9O75901 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RASSF9O75901 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RASSF9O75901 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RASSF9O75901 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RASSF9O75901 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RASSF9O75901 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RASSF9O75901 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RASSF9O75901 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RASSF9O75901 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RASSF9O75901 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RASSF9O75901 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RASSF9O75901 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RASSF9O75901 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RASSF9O75901 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RASSF9O75901 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RASSF9O75901 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RASSF9O75901 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms