Protein–RNA interactions for Protein: O60279

SUSD5, Sushi domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD5O60279 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SUSD5O60279 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SUSD5O60279 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SUSD5O60279 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SUSD5O60279 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SUSD5O60279 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SUSD5O60279 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SUSD5O60279 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SUSD5O60279 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SUSD5O60279 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SUSD5O60279 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SUSD5O60279 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SUSD5O60279 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SUSD5O60279 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SUSD5O60279 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SUSD5O60279 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SUSD5O60279 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SUSD5O60279 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SUSD5O60279 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SUSD5O60279 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SUSD5O60279 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SUSD5O60279 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SUSD5O60279 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SUSD5O60279 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SUSD5O60279 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SUSD5O60279 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SUSD5O60279 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SUSD5O60279 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SUSD5O60279 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SUSD5O60279 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SUSD5O60279 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SUSD5O60279 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SUSD5O60279 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SUSD5O60279 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SUSD5O60279 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SUSD5O60279 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SUSD5O60279 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SUSD5O60279 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SUSD5O60279 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SUSD5O60279 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SUSD5O60279 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SUSD5O60279 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SUSD5O60279 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SUSD5O60279 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SUSD5O60279 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SUSD5O60279 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SUSD5O60279 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SUSD5O60279 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SUSD5O60279 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SUSD5O60279 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SUSD5O60279 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SUSD5O60279 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SUSD5O60279 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SUSD5O60279 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SUSD5O60279 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SUSD5O60279 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SUSD5O60279 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SUSD5O60279 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SUSD5O60279 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SUSD5O60279 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SUSD5O60279 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SUSD5O60279 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SUSD5O60279 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SUSD5O60279 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SUSD5O60279 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SUSD5O60279 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SUSD5O60279 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SUSD5O60279 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SUSD5O60279 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SUSD5O60279 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SUSD5O60279 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SUSD5O60279 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SUSD5O60279 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SUSD5O60279 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SUSD5O60279 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SUSD5O60279 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SUSD5O60279 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SUSD5O60279 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SUSD5O60279 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SUSD5O60279 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SUSD5O60279 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SUSD5O60279 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SUSD5O60279 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SUSD5O60279 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SUSD5O60279 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SUSD5O60279 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SUSD5O60279 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SUSD5O60279 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SUSD5O60279 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SUSD5O60279 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SUSD5O60279 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SUSD5O60279 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SUSD5O60279 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SUSD5O60279 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SUSD5O60279 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SUSD5O60279 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SUSD5O60279 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SUSD5O60279 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SUSD5O60279 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SUSD5O60279 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms