Protein–RNA interactions for Protein: O43290

SART1, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 800 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SART1O43290 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SART1O43290 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SART1O43290 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SART1O43290 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SART1O43290 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SART1O43290 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SART1O43290 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SART1O43290 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SART1O43290 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SART1O43290 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SART1O43290 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SART1O43290 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SART1O43290 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
SART1O43290 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SART1O43290 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
SART1O43290 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SART1O43290 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SART1O43290 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SART1O43290 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SART1O43290 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SART1O43290 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SART1O43290 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SART1O43290 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SART1O43290 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SART1O43290 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SART1O43290 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SART1O43290 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SART1O43290 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SART1O43290 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SART1O43290 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SART1O43290 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SART1O43290 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SART1O43290 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SART1O43290 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SART1O43290 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SART1O43290 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SART1O43290 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SART1O43290 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SART1O43290 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SART1O43290 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SART1O43290 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SART1O43290 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
SART1O43290 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SART1O43290 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SART1O43290 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
SART1O43290 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SART1O43290 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SART1O43290 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SART1O43290 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SART1O43290 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SART1O43290 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SART1O43290 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SART1O43290 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SART1O43290 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SART1O43290 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SART1O43290 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SART1O43290 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SART1O43290 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SART1O43290 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SART1O43290 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SART1O43290 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SART1O43290 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SART1O43290 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SART1O43290 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SART1O43290 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SART1O43290 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SART1O43290 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SART1O43290 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SART1O43290 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
SART1O43290 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
SART1O43290 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SART1O43290 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SART1O43290 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
SART1O43290 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SART1O43290 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SART1O43290 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SART1O43290 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SART1O43290 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SART1O43290 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SART1O43290 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SART1O43290 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SART1O43290 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SART1O43290 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SART1O43290 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SART1O43290 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
SART1O43290 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SART1O43290 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SART1O43290 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SART1O43290 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SART1O43290 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SART1O43290 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SART1O43290 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SART1O43290 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SART1O43290 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SART1O43290 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SART1O43290 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SART1O43290 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SART1O43290 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SART1O43290 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SART1O43290 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms