Protein–RNA interactions for Protein: C9JLW8

MCRIP1, Mapk-regulated corepressor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCRIP1C9JLW8 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCRIP1C9JLW8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCRIP1C9JLW8 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MCRIP1C9JLW8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCRIP1C9JLW8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCRIP1C9JLW8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCRIP1C9JLW8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MCRIP1C9JLW8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MCRIP1C9JLW8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCRIP1C9JLW8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCRIP1C9JLW8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCRIP1C9JLW8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCRIP1C9JLW8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCRIP1C9JLW8 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCRIP1C9JLW8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCRIP1C9JLW8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MCRIP1C9JLW8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MCRIP1C9JLW8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCRIP1C9JLW8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCRIP1C9JLW8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MCRIP1C9JLW8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCRIP1C9JLW8 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MCRIP1C9JLW8 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCRIP1C9JLW8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCRIP1C9JLW8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCRIP1C9JLW8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCRIP1C9JLW8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MCRIP1C9JLW8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCRIP1C9JLW8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCRIP1C9JLW8 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MCRIP1C9JLW8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCRIP1C9JLW8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCRIP1C9JLW8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCRIP1C9JLW8 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCRIP1C9JLW8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCRIP1C9JLW8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCRIP1C9JLW8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCRIP1C9JLW8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCRIP1C9JLW8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MCRIP1C9JLW8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MCRIP1C9JLW8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MCRIP1C9JLW8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MCRIP1C9JLW8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCRIP1C9JLW8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCRIP1C9JLW8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCRIP1C9JLW8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCRIP1C9JLW8 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCRIP1C9JLW8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCRIP1C9JLW8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCRIP1C9JLW8 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCRIP1C9JLW8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCRIP1C9JLW8 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCRIP1C9JLW8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCRIP1C9JLW8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCRIP1C9JLW8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCRIP1C9JLW8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MCRIP1C9JLW8 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCRIP1C9JLW8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MCRIP1C9JLW8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCRIP1C9JLW8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCRIP1C9JLW8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCRIP1C9JLW8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCRIP1C9JLW8 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCRIP1C9JLW8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCRIP1C9JLW8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MCRIP1C9JLW8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCRIP1C9JLW8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
MCRIP1C9JLW8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCRIP1C9JLW8 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCRIP1C9JLW8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCRIP1C9JLW8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCRIP1C9JLW8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCRIP1C9JLW8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCRIP1C9JLW8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCRIP1C9JLW8 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCRIP1C9JLW8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCRIP1C9JLW8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCRIP1C9JLW8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCRIP1C9JLW8 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCRIP1C9JLW8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCRIP1C9JLW8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCRIP1C9JLW8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCRIP1C9JLW8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCRIP1C9JLW8 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCRIP1C9JLW8 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCRIP1C9JLW8 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCRIP1C9JLW8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
MCRIP1C9JLW8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCRIP1C9JLW8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCRIP1C9JLW8 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MCRIP1C9JLW8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCRIP1C9JLW8 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MCRIP1C9JLW8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCRIP1C9JLW8 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCRIP1C9JLW8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCRIP1C9JLW8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCRIP1C9JLW8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MCRIP1C9JLW8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCRIP1C9JLW8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCRIP1C9JLW8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 644 ms