Protein–RNA interactions for Protein: A8KAH6

HSPB2, Heat shock 27kDa protein 2, isoform CRA_a, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB2A8KAH6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HSPB2A8KAH6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HSPB2A8KAH6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HSPB2A8KAH6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HSPB2A8KAH6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HSPB2A8KAH6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
HSPB2A8KAH6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HSPB2A8KAH6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HSPB2A8KAH6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HSPB2A8KAH6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
HSPB2A8KAH6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HSPB2A8KAH6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HSPB2A8KAH6 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HSPB2A8KAH6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
HSPB2A8KAH6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HSPB2A8KAH6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HSPB2A8KAH6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HSPB2A8KAH6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HSPB2A8KAH6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HSPB2A8KAH6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HSPB2A8KAH6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HSPB2A8KAH6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HSPB2A8KAH6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HSPB2A8KAH6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HSPB2A8KAH6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
HSPB2A8KAH6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HSPB2A8KAH6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HSPB2A8KAH6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HSPB2A8KAH6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HSPB2A8KAH6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HSPB2A8KAH6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HSPB2A8KAH6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HSPB2A8KAH6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HSPB2A8KAH6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
HSPB2A8KAH6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HSPB2A8KAH6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HSPB2A8KAH6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HSPB2A8KAH6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HSPB2A8KAH6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HSPB2A8KAH6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HSPB2A8KAH6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HSPB2A8KAH6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HSPB2A8KAH6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HSPB2A8KAH6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HSPB2A8KAH6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HSPB2A8KAH6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HSPB2A8KAH6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HSPB2A8KAH6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HSPB2A8KAH6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HSPB2A8KAH6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HSPB2A8KAH6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HSPB2A8KAH6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HSPB2A8KAH6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HSPB2A8KAH6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HSPB2A8KAH6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HSPB2A8KAH6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HSPB2A8KAH6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HSPB2A8KAH6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HSPB2A8KAH6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HSPB2A8KAH6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
HSPB2A8KAH6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HSPB2A8KAH6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HSPB2A8KAH6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HSPB2A8KAH6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HSPB2A8KAH6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HSPB2A8KAH6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HSPB2A8KAH6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HSPB2A8KAH6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HSPB2A8KAH6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HSPB2A8KAH6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
HSPB2A8KAH6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HSPB2A8KAH6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HSPB2A8KAH6 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HSPB2A8KAH6 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HSPB2A8KAH6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HSPB2A8KAH6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
HSPB2A8KAH6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HSPB2A8KAH6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HSPB2A8KAH6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HSPB2A8KAH6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HSPB2A8KAH6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HSPB2A8KAH6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HSPB2A8KAH6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HSPB2A8KAH6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HSPB2A8KAH6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HSPB2A8KAH6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HSPB2A8KAH6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
HSPB2A8KAH6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HSPB2A8KAH6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HSPB2A8KAH6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HSPB2A8KAH6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HSPB2A8KAH6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HSPB2A8KAH6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HSPB2A8KAH6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HSPB2A8KAH6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HSPB2A8KAH6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HSPB2A8KAH6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HSPB2A8KAH6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HSPB2A8KAH6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HSPB2A8KAH6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms