Protein–RNA interactions for Protein: V9GYQ6

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V9GYQ6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
V9GYQ6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
V9GYQ6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
V9GYQ6 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
V9GYQ6 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
V9GYQ6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
V9GYQ6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
V9GYQ6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
V9GYQ6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
V9GYQ6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
V9GYQ6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
V9GYQ6 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
V9GYQ6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
V9GYQ6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
V9GYQ6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
V9GYQ6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
V9GYQ6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
V9GYQ6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
V9GYQ6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
V9GYQ6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
V9GYQ6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
V9GYQ6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
V9GYQ6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
V9GYQ6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
V9GYQ6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
V9GYQ6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
V9GYQ6 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
V9GYQ6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
V9GYQ6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
V9GYQ6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
V9GYQ6 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
V9GYQ6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
V9GYQ6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
V9GYQ6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
V9GYQ6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
V9GYQ6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
V9GYQ6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
V9GYQ6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
V9GYQ6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
V9GYQ6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
V9GYQ6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
V9GYQ6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
V9GYQ6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
V9GYQ6 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
V9GYQ6 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
V9GYQ6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
V9GYQ6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
V9GYQ6 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
V9GYQ6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
V9GYQ6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
V9GYQ6 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
V9GYQ6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
V9GYQ6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
V9GYQ6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
V9GYQ6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
V9GYQ6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
V9GYQ6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
V9GYQ6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
V9GYQ6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
V9GYQ6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
V9GYQ6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
V9GYQ6 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
V9GYQ6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
V9GYQ6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
V9GYQ6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
V9GYQ6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
V9GYQ6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
V9GYQ6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
V9GYQ6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
V9GYQ6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
V9GYQ6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
V9GYQ6 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
V9GYQ6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
V9GYQ6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
V9GYQ6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
V9GYQ6 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
V9GYQ6 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
V9GYQ6 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
V9GYQ6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
V9GYQ6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
V9GYQ6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
V9GYQ6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
V9GYQ6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
V9GYQ6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
V9GYQ6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
V9GYQ6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
V9GYQ6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
V9GYQ6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
V9GYQ6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
V9GYQ6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
V9GYQ6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
V9GYQ6 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
V9GYQ6 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
V9GYQ6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
V9GYQ6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
V9GYQ6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
V9GYQ6 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
V9GYQ6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
V9GYQ6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
V9GYQ6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms